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广州单细胞BCR测序多重荧光免疫组化

来源: 发布时间:2022年06月04日

免疫组库测序有必要做吗? 对于十的十二次方个以上的抗原识别基数来说,群体和个体间的免疫组库的丰富程度能够直接反应机体免疫系统情况,通常TCR/BCR的亚型越多,机体识别病原的能力越强,越不容易患病,但超过一定限度,也容易引发自身免疫性疾病。且机体的免疫组库也不是一成不变的,会随着年龄,环境,药物,患病等等因素,免疫组库多样性也时刻处于动态变化当中。由此,将免疫组库测序用于临床诊断和诊疗上,有助于对群体或个体间进行免疫监测,探究相关疾病和免疫应答的关系,监测免疫疗法的效果,研究疾病发生、发展的分子机制。烈冰开展了单细胞转录组、单细胞多组学以及空间转录组等多种产品在内的全套科研解决方案。广州单细胞BCR测序多重荧光免疫组化

Single Cell Sequencing技术,即利用优化后的高通量测序技术(NGS,Next Generation Sequencing)分析每一个单个细胞的序列信息,从而更高分辨率地揭示细胞间的细胞差异以及其在微环境中的功能情况。那么问题来了,如何获得单个细胞?如果无法获得单个细胞这一切都是不成立的;如何获得大批量的单个细胞?单个组织细胞群体通常在百万级别以上,如果被检测的测序细胞数量过小精确度不足;如何低成本地获得大批量单个细胞?单细胞测序成本非常高,尤其是需要测2000~3000个以上的细胞的时候,如果单个细胞的分选成本也很高,技术根本无法普及。所以,正因为这些问题的存在使得高通量测序在单个细胞测序应用中的普及度一直不足,直到几个突破性技术的诞生。广州单细胞BCR测序多重荧光免疫组化烈冰测序服务已助力300余篇国际主流期刊研究文章发表。

冰冻切片的空间转录组测序在RNA捕获、文库构建方面,需要将组织切片贴合在带有mRNA结合捕获探针的载玻片上,通过甲醛固定、H&E染色得到组织切片的形态结构。再进行透化处理,使细胞中的mRNA释放,并结合到芯片相邻的捕获探针上。将捕获的mRNA反转录合成cDNA并构建测序文库进行上机测序,从而获取基因表达信息。总体来说,空间转录组的实验流程包括:组织冻存-OCT包埋-冷冻切片-固定染色-组织透化-cDNA合成及建库-上机测序,而需要客户进行样本准备的步骤相对简单:组织冻存与OCT包埋。

单细胞测序实验再样本细胞上机分选签,需要对细胞数量、细胞活性进行准确判断,这对Single Cell分选标记、建库、下机数据的质量都具有着决定性的作用。如若细胞计数偏高,将会影响建库的成功率;计数偏低,则会显著提高双细胞的比例;而细胞活率过低,就会使测序数据的利用率大打折扣,因此把好单细胞悬液质量这一关尤为重要。而在铺板过程中,由于不同操作人员手法具有不可避免的差异,不同的液体流速将直接影响单细胞的入孔效果。因此烈冰生物BD Rhapsody单细胞分选平台配套了专门定制的电动移液器,其具有Prime Treat、Cell Load、Bead Load、Wash、Lysis、Retrieval多种操作模式,来对应各种不同的操作。通过已经设定的程序来控制液体的流速,大幅度降低人为操作习惯带来的差异,保证实验操作的一致性。国产化PanoCell单细胞测序平台,提供高性价比服务方案。

单细胞转录组测序是在单细胞水平上高通量测序分析基因表达谱的技术,突破传统高通量测序的局限性,组织解离后,单个样本一次上机能捕获500-20000个细胞, 基于每个细胞分别建库测序,获得单个细胞的基因结构和基因表达状态,并鉴定细胞的类型,可以在不同样本间从细胞类型的组成和丰度角度进行比较,反映细胞间的异质性。而2021年横空出世的10X Genomics Chromium X平台实现了单块chip上的百万级别通量的细胞捕获,系统实现16个通道同时运行,每个通道可捕获2000-20000个细胞(不混样),并支持原Chromium Controller体统外的多种细胞捕获百万级别通量实验,可准确鉴别稀有细胞类型和适配大规模单细胞研究。单细胞多组学测序可识别重要的转录因子,进行谱系和发育追踪。北京单细胞免疫组库测序多重荧光免疫组化

烈冰引进国际主流空间转录组测序平台,提供保留组织内部精细区域的空间信息的转录组测序。广州单细胞BCR测序多重荧光免疫组化

单细胞测序技术(Single Cell Sequencing)从一种新兴的研究角度,借助已有的高通量测序手段,帮助研究者在疾病样本的异质性、样本微环境、发育学、免疫学以及其他领域中进行单细胞层面的数据解析,解决了Bulk Population Sequencing所无法解决的问题。这样一个新的研究领域必然也需要足够可靠的实验手段来支撑。BD Rhapsody单细胞分选系统为此提供了完善的硬件设备,保证了从单细胞悬液质量评估到单细胞分选标记过程中每一个实验步骤的完善质控。NovelBio单细胞实验团队借助BD Rhapsody单细胞分选系统,在实验实施层面对单细胞测序结果的可靠性提供了强有力的保证。继单细胞悬液制备之后,又在另一道关键关卡提供了可靠的支持,帮助研究者在单细胞测序领域收获更多的成果。广州单细胞BCR测序多重荧光免疫组化

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