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苏州BD单细胞实验平台

来源: 发布时间:2022年09月13日

单细胞测序实验再样本细胞上机分选签,需要对细胞数量、细胞活性进准判断,这对SingleCell分选标记、建库、下机数据的质量都具有着决定性的作用。如若细胞计数偏高,将会影响建库的成功率;计数偏低,则会提高双细胞的比例;而细胞活率过低,就会使测序数据的利用率大打折扣,因此把好单细胞悬液质量这一关尤为重要。而在铺板过程中,由于不同操作人员手法具有不可避免的差异,不同的液体流速将直接影响单细胞的入孔效果。因此烈冰生物BDRhapsody单细胞分选平台配套了专门定制的电动移液器,其具有PrimeTreat、CellLoad、BeadLoad、Wash、Lysis、Retrieval多种操作模式,来对应各种不同的操作。通过已经设定的程序来控制液体的流速,大幅度降低人为操作习惯带来的差异,保证实验操作的一致性。烈冰一站式单细胞测序服务:立足科学研究,解码生命本质。苏州BD单细胞实验平台

现有的单细胞测序技术阵营在几个主要领域存在差别。一个是基于微流控通道的细胞与Beads的在通道内的动态结合,通过油相水相不相容的特点将结合了的细胞和Beads进行分隔,在这个空间,单个细胞的内容物释放,转录本或其他生物分析物被标记或添加索引,以便下游识别。BDRhapsody单细胞测序平台采用静态微孔技术(Cyto-Seq具有类似的技术原理)。通过微孔板的物理分隔,将一个个单个细胞和带有标签的磁珠,一对一的“框”在微反应的物理平台中。这样,每一个细胞都会结合一个磁珠,那么在每一个磁珠中上长满了不同的CellBarcode和UMIBarcode连接形成的序列,再加上一端PolyT的抓手,这个抓手就会使用oligodT抓住mRNA构建文库。上海BD Rhapsody单细胞测序服务公司烈冰生物全国五大实验中心,多地部署BD Rahpsody平台,助您的样本更快速抵达“战场”。

烈冰生物在上海、北京、广州、西安、江西等多地部署单细胞测序实验组中心,多地部署搭建BDRhapsody单细胞实验平台,基于微孔的强大的高通量单细胞分析系统,为您提供可靠的单细胞分析工作流程,该系统可通过简单的唯恐把工作流程和多重条码标记系统,对高通量单细胞进行多组学的信息捕获,由此捕获的信息科进一步生成各种类型的二代测序(NGS)文库。之后对文库进行测序和基于NovelBrain生物大数据分析平台(云平台)的数据可视化分析,实现高位分辨率下的组织内基因的表达差异和表达丰度。

基于测序的数据能够将彰显其强大之处,因为它能够了解同一单细胞的多种生物分析指标。如果说单细胞基因表达提供了一种颜色的详细信息,那么单细胞多组学提供了同一细节的全彩色图谱,为您带来样本的真实视图。烈冰自2019年引进的BDRhapsody单细胞平台以来,能够从同一单细胞中读取细胞复杂性的多组学特征。与传统方法不同,单细胞多组学简化了您需要开展的实验,也节省了您需要分析的样本,而能获得相同的结果。这不但节省了宝贵的样本,还保证了更高的生物学准确性,因为您不需要匹配拆分样本的数据集并通过计算来推断各个组学之间的关系。烈冰单细胞多组学测序助您探究细胞类型特异性和基因调控网络特征。

据不完全统计,截至2022年6月,烈冰生物助力发表单细胞文章近40篇,从平台应用比例来看,应用10XGenomics和BDRhapsody两大平台发文比例各占50%左右,研究类型涵盖疾病发展,靶点探索,免疫研究,神经发育,干细胞分化,植物发育,退行病变,糖尿病,COVID-19等等研究;从发表期刊水平来看,烈冰生物联合发表的单细胞文章,CNS一区期刊占比在30%以上,其中包括immunity三篇,Nature子刊3篇(Naturecellbiology,NaturePlants,Naturecommunication),风湿类领域ARD期刊1篇,CUT1篇,AdvancedScience多篇,IF大于10分以上文章占比高达68.5%,烈冰专属单细胞测序服务团队,将与您携手谱写下一篇“高分”新文章。助力探索生命时空多维度的动态变化的生物学信息;助力医疗健康时代!湖州BD VDJ单细胞多组学测序

单细胞测序是高通量测序下的又一重大技术突破。苏州BD单细胞实验平台

由于高通量测序实验方法相关的测序成本,使得单细胞实验往往非常昂贵,烈冰生物BDRhapsody单细胞测序服务珍视您的每一份样本,在平台搭建前,我们测试评估了BDRhapsody的性能,与BD官方公布的数据结合来看,将人293T和小鼠NIH/3T3细胞的1:1混合物以不同浓度上样到BDRhapsody卡式芯片上。存储的cDNA分子普遍扩增并进行低通量测序(每个细胞月8700个读数)。在测序数据中检测到1109个细胞的上样条件下,每个细胞中,来自每个细胞的平均99.4%的分子经检测为人或小鼠,这表明微孔之间的串扰非常小,在测序数据中检测到1000个或更少细胞的上样密度下,多重态发生率接近零,并且在15000个细胞下小于5%。苏州BD单细胞实验平台

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