在做有氧运动时（低强度的运动），这个低强度运动只需要足够的额外能量，提供给身体能提高一点效率的需要；为了提高效率，它舍弃了那些我们不需要的废弃细胞部分。如果增加运动强度，身体会进入高压模式，自噬的效果开始减弱。因此，保持适当运动强度才可以提高身体的自噬能力，主要原因是：(1)乙酰辅酶A的耗竭。当你用尽燃料（葡萄糖）时，身体开始启动自噬；当用尽蛋白质、脂肪、碳水化合物时，身体开始提高自噬作用（因为没有食物可用）。(2)降低mTOR。mTOR是自噬的启动信号，当举重、增肌，甚至增脂时就会释放出自噬的信号。它们的关系很像胰岛素和血糖的关系，当自噬高时，mTOR会低，而当mTOR高时，自噬能力会低，两者不断地保持一种平衡。当你在做一些轻松的运动，mTOR低，自噬能力提高；当你做比较强的度运动，mTOR升高，自噬能力降低。因为身体只是在试图修復和建造，而不是要消化所有储备的能量。(3)提高AMPK。AMPK是体内能量传感器，当你用尽燃料时，这个传感器将把开关打开，开始从体内脂肪和整个身体中吸收能量，包含吸收老旧细胞，这就是自噬，这也是心肺运动如此强大的地方。溶酶体是自噬完成的关键场所。山东细胞自噬溶酶体
自噬紊乱也可能在类风湿性关节炎、多发性硬化等其他自身免疫病的发生中起到一定作用。自噬的信号通路非常复杂，有许多蛋白都可作为调控自噬的靶点，并针对其开发药物。按照对自噬功能的影响，这些分子大体可分为自噬促进剂和自噬阻止剂两类。自噬促进剂一般通过模拟饥饿或营养缺乏来实现对自噬的刺激作用。这一类分子较常见的是TOR激酶（mTOR）阻止剂。由于mTOR是细胞中主要的能量感受器，阻止mTOR相当于模拟细胞饥饿时的状态。如前文中的机理所述，阻止mTOR会解除Atg13的磷酸化，进而唤醒自噬。有几种mTOR阻止剂已经进入市场，例如雷帕霉素（Rapamycin,又称西罗莫司Sirolimus）、依维莫司（Everolimus）和索拉非尼（Sorafenib）。山东细胞自噬溶酶体启动人体骨骼肌自噬的有效策略是运动强度，剧烈运动是肌肉自噬的较有效诱因。
在骨生长和骨重建过程中，溶酶体对骨质的更新起着重要重要的作用。破骨细胞的溶酶体酶能释放到细胞外，分解和消除陈旧的骨基质，这是骨质更新的一个重要步骤。溶酶体酶释放的具体过程可能是：细胞内的环化酶活性发生改变后，随着cAMP的增加，蛋白质激酶被活化而引起微管及其周围的蛋白质的磷酸化，其结果微管发生聚集，致使溶酶体向细胞膜方向移动，并与细胞膜相互融合，然后溶酶体内的水解酶被排出细胞外，以分解和消除陈旧的骨质。
大自噬，也就是通常说的自噬，是真核细胞蛋白降解的途径之一。自噬可以被描述为细胞质内的成分（细胞器、蛋白等）被双层膜的囊泡包裹，形成自噬体，进而传递到溶酶体进行降解的过程。详细来说，自噬过程与内涵体途径密不可分。一方面，自噬体能够与晚期内体融合形成中间囊泡终形成自噬溶酶体；另一方面，自噬体能够直接与溶酶体融合形成自噬溶酶体。无论通过哪条途径，自噬溶酶体较终通过酸性水解酶将细胞器、蛋白等消化分解。细胞本底水平的自噬发生在营养充足的条件下，可保护细胞免受错误折叠蛋白或受损细胞器的影响，从而防止某些疾病的发生（如神经退行性疾病和病症）。饥饿等也可诱导自噬的发生，通过降解大分子物质和细胞器为细胞活动提供营养和能量。溶酶体中的酶随后将自噬体内容物降解。
什么是自噬？简单来说，细胞自噬，就好像一台电脑，用时间长了，出问题了，而断食引发的细胞自噬，就像是给它重装系统，让它焕然一新。自噬（Autophagy），希腊语“auto”（自我）和“phagein”（进食），直接翻译过来就是，自己吃自己。从专业上说是，细胞溶质的成分被降解，然后通过溶酶体（细胞里面有一个专门的小隔间，里面有消化蛋白质，碳水，和脂肪的酶，专门管这个小隔间叫做溶酶体（lysosome）），回收细胞中损坏的元件，循环再利用，组成一个新的细胞。在病变发生的发展的不同阶段，自噬的作用可能不同。山东mRFP-GFP-LC3双荧光自噬慢病毒包装
大自噬是较为主要的自噬通路，负责将细胞质内物质通过中间双重细胞膜囊泡传输至溶酶体。山东细胞自噬溶酶体
细胞经诱导或阻止后，需对自噬过程进行观察和检测，常用的策略和技术有：1、利用WesternBlot检测LC3-II/I比值的变化以评价自噬形成自噬形成时，胞浆型LC3（即LC3-I）会酶解掉一小段多肽，转变为（自噬体）膜型（即LC3-II），因此，LC3-II/I比值的大小可估计自噬水平的高低。（注意：LC3抗体对LC3-II有更高的亲和力，会造成假阳性。方法2和3需结合使用，同时需考虑溶酶体活性的影响。）2、检测长寿蛋白的批量降解：非特异。3、MDC（Monodansylcadaverine，单丹磺酰尸胺）染色：包括自噬体，所有酸性液泡都被染色，故属于非特异性的。4、CellTrackerTMGreen染色：主要用于双染色，但其能染所有的液泡，故也是属于非特异性的。山东细胞自噬溶酶体