河北冻干粉形式PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究

Genovis的ImpaRATOR™ 可用于多种 O-聚糖：依那西普是一种融合蛋白，由TNF受体的胞外结构域与人IgG1的Fc部分相连。该蛋白质在Fc区域上方含有多达13个O-糖基化的Ser/Thr残基簇，使其成为一种非常难以在结构上表征的生物制药。为了证明ImpaRATOR的聚糖特异性，制备了三种具有不同聚糖组成的依那西普样品：（i）携带单唾液酸和二唾液酸化he心1结构混合物的未经处理的糖蛋白，（ii）用SialEXO处理的糖蛋白去除唾液酸并产生裸核1结构，以及（iii）用SialEXO和GalactEXO处理的糖蛋白产生单个GalNAc残基， 也称为Tn抗原。用ImpaRATOR和FabRICATOR在一锅反应中处理三个样品（图1）。作为比较，SialEXO处理的依那西普用OpeRATOR和FabRICATOR处理。将所得肽还原、烷基化并用HILIC-MS进行分析。FabRICATOR被包括在反应中，以将Fc区与大多数C端糖肽分离，以促进其表征。FucosEXO从一组dai表不同键的不同寡糖底物中释放的岩藻糖。FucosEXO对α1-6连接的岩藻糖残基没有活性。河北冻干粉形式PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究

为了研究 OglyZOR 对天然糖蛋白的活性，将该酶与依那西普、TNFR 和阿巴西普在 37°C 下有或没有 SialEXO 孵育 1 小时。当唾液酸被去除时，OglyZOR酶有效地水解了所有三种底物中的O-聚糖。Genovis的OglyZOR 酶可有效水解天然糖蛋白中的he心 1 二糖 （Gal-β1,3-GalNAc）。这使得这些酶适合在LC-MS分析之前制备样品，以鉴定其他PTM或确认氨基酸序列O-糖基化生物制药的全去糖基化：O-糖基化生物制药（如依那西普）很难表征。为了能够通过质谱法测定完整质量数，我们进行了酶促总去糖基化。N-聚糖被Genovis的PNGase F裂解，而O-聚糖可以与OglyZOR和SialEXO一起去除。。河北固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究OmniGLYZOR Microspin 小柱中包含以下组分：PNGase F；O-糖苷酶。

C1抑制剂的去糖基化：在O-糖基化生物制药的生产过程中，由于he心GalNAc残基的加工不完全，可能会出现Tn抗原。这表现为具有 203 Da HexNAc 单位差异的重复质量位移。为了确认 Tn 抗原的存在，可以应用以下工作流程，此处在重度（26 个位点）O-糖基化 C1 抑制剂上演示。首先，使用PNGaseF修剪糖蛋白的N-糖，使用Genovis的OglyZOR和SialEXO修剪he心1 O-糖。依那西普的磷性能测试 ：依那西普是另一种具有挑战性的生物制药模型分子，携带 13 个 O-聚糖位点，其中平均 9 至 10 个位点被占用。

在这里，Genovis分析了 C1 抑制剂——一种人血浆衍生的生物zhiliao药物，由 6 种 N-聚糖和多达 28 种 O-聚糖修饰，主要由唾液酸he心 1 结构组成。在不对这种高度异质的蛋白质进行任何预处理的情况下，反相LC-MS分析产生了无法详细解释的复杂质谱图。在天然条件下使用OmniGLYZOR Microspin色谱柱，可在3小时内有效去除所有O-聚糖。然而，蛋白质上仍残留着 1 到 3 个 N-聚糖。使用冻干的PNGase F和OmniGLYZOR试剂盒中包含的MS友好型RapiGest™ SF表面活性剂*，在变性条件下通过额外的去糖基化步骤去除这些不可接近的N-聚糖。观察到所有聚糖的完全去除，但分子上存在的少量he心 2 O-聚糖除外。水解O-聚糖的酶不会从变性中获益，这就是为什么OmniGLYZOR Microspin色谱柱只能在非变性条件下使用的原因。并在FabRICATOR消化后使用LC-MS在亚基水平上研究酶活性。TNFR和Fc/2片段分别分析。

Genovis的SialEXO Immobilized是一种微离心柱，用于在室温下孵育30分钟后完全去除0.5mg天然糖蛋白上的唾液酸。为了研究依那西普的潜在电荷变体，开发了一种使用SialEXO固定化柱对糖蛋白进行去唾液酸化的一般工作流程。毛细管电泳通常用于在生物制剂的表征和质量控制过程中确定电荷变体。使用SialEXO Imfixedized对糖蛋白进行去唾液酸化，并使用ProteinSimple的Maurice在成像等电聚焦中进行分析。综合起来，该分析工作流程改进了糖蛋白的分离并实现了电荷异构体分析。依那西普，如果不首先去除唾液酸，将很难分析，但使用SialEXO固定化分离峰可以获得。FucosEXO固定化离心柱含有与琼脂糖珠共价偶联的FucosEXO酶；河北固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究

PNGase F是一种非常成熟的工具。O-糖的去除可能更具挑战性，现有的O-糖释放化学方法不太适合下游分析。河北冻干粉形式PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究

Genvois的SialEXO产品是唾液酸酶，用于N-和O-糖基化蛋白的有效去唾液酸化。SialEXO冻干由两种唾液酸酶组成，每种唾液酸酶都具有独特的活性，并且它们同时起作用。一种酶对α2-3、α2-6和α2-8连接的唾液酸具有很好的活性，另一种酶（SialEXO 2-3）通过α2-3-键快速水解唾液酸。SialEXO冻干可在2小时内去除天然蛋白质上的所有唾液酸。SialEXO在天然条件下水解糖蛋白，在pH值范围为6.5至9时显示出活性。这些酶来源于Akkermansia muciniphila，并在大肠杆菌中表达。两种酶都含有 His 标签，酶的分子量为 43 kDa 和 66 kDa。 河北冻干粉形式PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究