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南京PanoCell单细胞测序分析

来源: 发布时间:2022年06月05日

Single Cell Sequencing技术,即利用优化后的高通量测序技术(NGS,Next Generation Sequencing)分析每一个单个细胞的序列信息,从而更高分辨率地揭示细胞间的细胞差异以及其在微环境中的功能情况。那么问题来了,如何获得单个细胞?如果无法获得单个细胞这一切都是不成立的;如何获得大批量的单个细胞?单个组织细胞群体通常在百万级别以上,如果被检测的测序细胞数量过小精确度不足;如何低成本地获得大批量单个细胞?单细胞测序成本非常高,尤其是需要测2000~3000个以上的细胞的时候,如果单个细胞的分选成本也很高,技术根本无法普及。所以,正因为这些问题的存在使得高通量测序在单个细胞测序应用中的普及度一直不足,直到几个突破性技术的诞生。烈冰生物为您提供一站式全流程高通量测序服务。南京PanoCell单细胞测序分析

烈冰生物已空间转录组测序服务提供从一个组织切片样本中获取包括空间信息在内的全部转录组数据,从而可以区分和定位功能基因在特定组织区域内的活跃表达。其可以检测组织样本中的所有基因活动,并绘制活动发生的位置,这将有助于科学家更好地构建生物图谱,并进一步理解疾病和生物学过程。目前,空间转录组主要应用于多种疾病、免疫、发育、神经和病理学等研究领域。烈冰生物具有专业的实验团队、丰富的切片经验,配置了国际主流的仪器设备,实验团队针对不同组织类型优化完善实验方案,并制定了严谨规范的实验室SOP流程,保证空间转录组切片的质量,全优保障测序数据质量。宁波单细胞测序服务机构烈冰科技成立10余年,为科研学者提供专注的测序数据分析服务。

空间组测序技术,作为现阶段单细胞技术的重要补充技术进入了组学的实验领域以及生物信息学的分析领域。通过单细胞测序(单细胞表达尺度)+ 空间转录组测序(空间表达尺度)+数字病理(临床诊断尺度)联合分析可在空间和时间上描述不断演变的组织生态系统,多角度深入分析组织的形态特征、基因组学特征、表观遗传调控因子以及样本中的免疫微环境。不同于单细胞测序分析的需求-分析-需求-分析的模式,空间转录组分析实际上是非常需要研究者和企业之间的互动的,尤其是对于组织切片的理解,一个在线互相交流空间转录组测序结果的系统也是空转分析中不可或缺的一环,也是重中之重。

烈冰科技作为国内同时拥有10X Genomics和BD Rhapsody双分选平台的测序服务商及云计算服务供应商,经过多年实战,拥有丰富的单细胞悬液制备和分选经验,实测BD Rhapsody对能够高效捕获粒细胞。针对不同的分选平台、建库方法,实战总结搭建出不同的数据预处理工作流程;烈冰科技NovelBrain®生物大数据平台能有效支撑生命科学研究、医疗健康等领域对大数据分析的需求。完备的高通量测序实验平台,包括NovaSeq 6000、10X Chromium X、BD FACSMelody、PANNORAMIC数字切片扫描仪等,配合一支来自海内外名校、多学科交叉型的高素质综合团队,为您的科学研究保驾护航。烈冰引进国际主流空间转录组测序平台,提供保留组织内部精细区域的空间信息的转录组测序。

什么是染色质可及性? 正常情况下,DNA与核小体缠绕折叠在一起形成染色质,但是DNA的复制、转录都是需要将染色体的高级结构解开的,然而解压并不需要将整个染色体全部打开,而只需要打开一部分,即需要表达基因的区域。这部分打开的染色质,就叫开放染色质(open chromatin)。打开染色质,允许部分调控蛋白(比如转录因子和辅因子)过来与之相结合的特性,即染色质的可及性(chromatin accessibility)。ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin with highthroughput sequencing),即利用转座酶研究染色质可及性的高通量测序技术,通俗来说就是将携带测序信息的转座酶等插入开放性染色质中进行识别,进一步通过高通量测序及生物信息学分析来挖掘相关基因信息,以探究生物学相关问题。与ScRNA-Seq类似,ScATAC-seq也是在ATAC-Seq的基础上,解决不同细胞群体的异质性的问题,检出混杂样品测序所无法得到的异质性信息。助力探索生命时空多维度的动态变化的生物学信息;助力生命健康医疗大时代!杭州空间转录组测序公司

基因测序相关产品和技术已由实验室研究逐渐演变到临床应用,是下一个改变世界的技术。南京PanoCell单细胞测序分析

多样本数据合并:Fraction of Reads Kept:合并样本时,各样本根据Mapped Barcoded Reads per Cell数量计算出来的数据利用率。如果各样本间该参数值相差很大,需要进行Downsample处理,以数据量少的样本为基准将不同样本中细胞测序深度标化到同一水平,从而避免因测序深度差异导致的基因检测数量、基因表达水平的差异。烈冰科技自主研发的单细胞云平台致力于帮助每一位客户定制化分析数据,深入解读数据分析结果,深入挖掘其背后的生物学意义;从操作便捷、结果可视化、分析可追溯、系统稳定等方面助力单细胞研究,加速科研进程!南京PanoCell单细胞测序分析

上海烈冰生物医药科技有限公司一直专注于生物科技、医药科技、信息科技、计算机科技领域内的技术开发、技术服务、技术转让、技术咨询,市场营销策划,市场信息咨询与调查(不得从事社会调查、社会调研、民意调查、民意测验),从事货物及技术的进出口业务,计算机、软件及耗材(除专控),软件开发【依法须经批准的项目,经相关部门批准后方可开展经营活动】,是一家医药健康的企业,拥有自己**的技术体系。目前我公司在职员工以90后为主,是一个有活力有能力有创新精神的团队。诚实、守信是对企业的经营要求,也是我们做人的基本准则。公司致力于打造***的单细胞测序,生物大数据云分析平台,空间转录组测序,单细胞多组学测序。公司凭着雄厚的技术力量、饱满的工作态度、扎实的工作作风、良好的职业道德,树立了良好的单细胞测序,生物大数据云分析平台,空间转录组测序,单细胞多组学测序形象,赢得了社会各界的信任和认可。

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