科研的魅力之处，在于无穷尽的探寻生命的本底，通过单细胞测序，我们对组织的分子基础的研究也从初级到深层，并在单细胞层面逐渐达成一致，那么不禁要问一句，组织的空间位置到底重不重要？空间异质性是不同疾病样本功能的关键特征，细胞的位置信息更能反应细胞命运调控机制和细胞谱系发生过程。因此时间和空间即像组织的AB面，而不可否认的是，此时空间坐标的记录，像一个还未长大的娃娃，虽未触及分子基础研究的深层，但仍在努力攀登探寻生命本底的下一个高峰。单细胞测序技术提供了单个细胞水平下的科学研究视角。上海单细胞免疫组库测序多重荧光免疫组化
烈冰科技自主研发的单细胞云平台致力于帮助每一位客户定制化分析数据，深入解读数据分析结果，深入挖掘其背后的生物学意义；从操作便捷、结果可视化、分析可追溯、系统稳定等方面助力单细胞研究，加速科研进程！此外，烈冰生信团队根据丰富的实战经验为用户量身打造了一款单细胞测序结果解读的神兵利器——单细胞浏览器（Single Cell Browser），不仅可以将海量复杂的结果文件可视化，还可以实现分析结果的三维立体化的展示呈现。专业的生信代码交给专业的烈冰，专业的生物学意义交给专业的您！宁波空间转录组测序多重荧光免疫组化搭建多种测序数据的生物信息分析平台，5000+项目检验，真实可信赖。
相对于Smart-Seq技术在细胞数量上的问题，BD和10X这两个平台普遍提供的细胞数量都在1-6K不等的测序细胞量，这个量级的测序细胞量已经可以说能够完全覆盖绝大部分组织的Single Cell群体类型。因此，这两种技术对于基于基因表达进行准确细胞分型上，无论是从细胞数量上来说还是表达检测可靠性来说，都会更实用。同时依托Random Cell Label技术，使得其对于NovaSeq、HiSeq X Ten、Hiseq 4000等设备存在的Index hooping现象，相对于Smart-Seq数据来说，影响几乎可以忽略不计（10X Genomics官方网站曾给出hooping测试结果，显示无影响。
单细胞测序结果动辄上百G数据量，庞大的数据对于分析平台和分析能力有着很高的要求，首先针对下机数据的质控环节：单细胞测序产生数亿的结果序列，不可避免的会出现低质量的测序结果，存在各种情况的序列污染。因此序列过滤及质量评估就会变得极为重要。序列质量主要通过测序质量值Q20/Q30的占比来表征，即碱基测序结果的错误率在1% / 0.1%以下的比例。理想的测序结果reads的碱基质量均高于30。保证数据获得后第一步的处理结果的准确性，为后续细胞类型鉴定准确和功能分析打下坚实基础。烈冰开展了单细胞转录组、单细胞多组学以及空间转录组等多种产品在内的全套科研解决方案。
针对单细胞测序的细胞数量判断环节：主要是对细胞数量、基因表达量、测序质量进行整体描述。过滤标准：由于细胞破碎后游离RNA会释放到环境或孔中，并且测序中也会存在一些死细胞，导致数据存在background值。因此，我们需要设定一定的标准来过滤掉假细胞或死细胞。以10× Genomics为例，细胞数量判断主要通过分析UMI Counts-Barcode曲线斜率拐点，当存在多个斜率拐点的时候，结合预期UMI=500时的细胞数量进行过滤。当斜率拐点低于UMI=500的时候，选择UMI=500作为细胞的判断的标准；否则，选择和预期细胞数量非常接近的拐点作为细胞判断的位置。这样我们能够有效获得真实的并且在基因数量上可以分析的数据。烈冰生物为您提供一站式全流程单细胞测序服务。广州单细胞多组学测序多重荧光免疫组化
测序可准确地分析基因表达差异、基因结构变异、筛选分子标记（SNPs或SSR）等生命科学重要问题。上海单细胞免疫组库测序多重荧光免疫组化
什么是染色质可及性？ 正常情况下，DNA与核小体缠绕折叠在一起形成染色质，但是DNA的复制、转录都是需要将染色体的高级结构解开的，然而解压并不需要将整个染色体全部打开，而只需要打开一部分，即需要表达基因的区域。这部分打开的染色质，就叫开放染色质（open chromatin）。打开染色质，允许部分调控蛋白（比如转录因子和辅因子）过来与之相结合的特性，即染色质的可及性（chromatin accessibility）。ATAC-seq（Assay for Transposase-Accessible Chromatin with highthroughput sequencing），即利用转座酶研究染色质可及性的高通量测序技术，通俗来说就是将携带测序信息的转座酶等插入开放性染色质中进行识别，进一步通过高通量测序及生物信息学分析来挖掘相关基因信息，以探究生物学相关问题。与ScRNA-Seq类似，ScATAC-seq也是在ATAC-Seq的基础上，解决不同细胞群体的异质性的问题，检出混杂样品测序所无法得到的异质性信息。上海单细胞免疫组库测序多重荧光免疫组化
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