机体为响应各种应激，其细胞会从一种功能“状态”转变为另一种功能“状态”；当细胞在不同状态之间转变时，往往会经历转录重组，导致一些基因被“沉默”，一些基因被重新“唤醒”，但纯化这些瞬态细胞进行研究是很困难或不可能的；scRNA-seq拟时序分析可以让我们在不需要纯化的情况下查看这些细胞状态。拟时序分析，即根据不同细胞亚群基因表达量随时间的变化情况，构建细胞谱系发育，但这里的时间并不是真时间，而是一个虚拟的时间，是指的细胞与细胞之间的转化和演替的顺序和轨迹。即使在同一个样本中，也会存在多种不同的细胞形态。因此，不论测定了多少样本，我们都可以采用拟时序分析对样本中的细胞转化和变化进行描述。单细胞测序技术的迅速发展和应用推广，为从多维度揭示疾病进展提供了强有力的工具。上海BD VDJ测序服务机构
针对单细胞测序的细胞数量判断环节：主要是对细胞数量、基因表达量、测序质量进行整体描述。过滤标准：由于细胞破碎后游离RNA会释放到环境或孔中，并且测序中也会存在一些死细胞，导致数据存在background值。因此，我们需要设定一定的标准来过滤掉假细胞或死细胞。以10× Genomics为例，细胞数量判断主要通过分析UMI Counts-Barcode曲线斜率拐点，当存在多个斜率拐点的时候，结合预期UMI=500时的细胞数量进行过滤。当斜率拐点低于UMI=500的时候，选择UMI=500作为细胞的判断的标准；否则，选择和预期细胞数量非常接近的拐点作为细胞判断的位置。这样我们能够有效获得真实的并且在基因数量上可以分析的数据。宁波单细胞BCR测序技术支持烈冰全线实验平台满足超深度、大规模发现和复杂疾病研究的测序。
RNA测序（RNA-seq）是转录组学研究的重要工具，也是生命科学领域常用的技术之一。相比于传统通路研究低维度、低通量的局限性，转录组学有以下优势：1）能够动态考察细胞基因组的表达，多维度地反映差异变化；2）可用于研究占RNA绝大部分的非编码RNA，研究其结构以及在细胞生命活动中的重要调控作用；3）与蛋白组学研究相互补充，多角度呈现细胞水平的变化信息。作为转录组学研究的技术基础，RNA测序技术也在不断地更新迭代，现如今更大通量、更深精度的测序为众多科研和医学工作者提供了丰富的工具和探索真理的手段。
空间转录组测序的数据质量和玻片有效区域的利用率、贴片的质量和透化时间息息相关。贴片质量不良会影响总的有效spot数等；而透化不合理会导致spot的reads数、基因中位数等参数。而 在特异性基因表达方面，我们也可以统计空间转录组群体的特异性基因表达即Markergene，将他们在组织切片以及空转上进行着色。我们也可以对于任意一个已知的基因或者数据库中的一些细胞Marker，然后将其在基因表达在空间转录组的切片以及HE染色上展示自己的基因表达进而了解，群体中的可能的细胞组成关系。 烈冰引进国际主流空间转录组测序平台，提供保留组织内部精细区域的空间信息的转录组测序。
科研的魅力之处，在于无穷尽的探寻生命的本底，通过单细胞测序，我们对组织的分子基础的研究也从初级到深层，并在单细胞层面逐渐达成一致，那么不禁要问一句，组织的空间位置到底重不重要？空间异质性是不同疾病样本功能的关键特征，细胞的位置信息更能反应细胞命运调控机制和细胞谱系发生过程。因此时间和空间即像组织的AB面，而不可否认的是，此时空间坐标的记录，像一个还未长大的娃娃，虽未触及分子基础研究的深层，但仍在努力攀登探寻生命本底的下一个高峰。烈冰斥巨资引进Novaseq6000，开启更大通量测序新纪元。深圳免疫组库测序
烈冰测序数据分析平台，不依赖已有物种信息，可研究非模式物种，针对不同平台的数据，制定多套流程；上海BD VDJ测序服务机构
什么是染色质可及性？ 正常情况下，DNA与核小体缠绕折叠在一起形成染色质，但是DNA的复制、转录都是需要将染色体的高级结构解开的，然而解压并不需要将整个染色体全部打开，而只需要打开一部分，即需要表达基因的区域。这部分打开的染色质，就叫开放染色质（open chromatin）。打开染色质，允许部分调控蛋白（比如转录因子和辅因子）过来与之相结合的特性，即染色质的可及性（chromatin accessibility）。ATAC-seq（Assay for Transposase-Accessible Chromatin with highthroughput sequencing），即利用转座酶研究染色质可及性的高通量测序技术，通俗来说就是将携带测序信息的转座酶等插入开放性染色质中进行识别，进一步通过高通量测序及生物信息学分析来挖掘相关基因信息，以探究生物学相关问题。与ScRNA-Seq类似，ScATAC-seq也是在ATAC-Seq的基础上，解决不同细胞群体的异质性的问题，检出混杂样品测序所无法得到的异质性信息。上海BD VDJ测序服务机构
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