2022年2月，亚特兰大埃默里大学医学院的Erik C. B. Johnson课题组在Nature neuroscience发表了题为 “Large-scale deep multi-layer analysis of Alzheimer’s disease brain reveals strong proteomic disease-related changes not observed at the RNA level”的研究成果，通过基因组学、转录组学、TMT标记定量蛋白质组学、代谢组学的研究方法，揭示了新的与AD相关的蛋白共表达模块，部分模块在RNA的网络中不存在。这为开发疾病***的潜在靶点提供依据，为临床的蛋白质组研究提供重要价值。蛋白质组学测序 蛋白组学技术缺点。福建干眼蛋白组学
定量蛋白质组学研究：2022年2月，上海市农业科学院食用菌研究所鲍大鹏研究员课题组在《FrontiersinMicrobiology》期刊发表的题为“OxidativeStressandAutophagyAreImportantProcessesinPostRipenessandBrownFilmFormationinMyceliumofLentinulaedodes”的研究成果，通过iTRAQ标记定量蛋白组学、GC-MS非靶向代谢组学等技术对香菇菌丝进行定量蛋白质组学和代谢组学分析，发现氧化应激和自噬是香菇菌丝后熟转色重要过程，并对其在蛋白质组和代谢组水平上的分子机制有了新的认识。涉及的欧易/鹿明生物服务产品：iTRAQ标记定量蛋白组学、GC-MS非靶向代谢组学山东蛋白组学靶向和非靶向蛋白质组学-鹿明生物丨欧易生物。
本研究采用串联质量标签（TMT）标记的蛋白质组学和平行反应监测（PRM）技术，对莲子脱水过程中的生理调控网络进行了深入研究表明，碳水化合物代谢（包括糖酵解/糖异成、半乳糖代谢、淀粉和蔗糖代谢、磷酸戊糖途径和细胞壁组织）、ER中的蛋白质加工、DNA修复和抗氧化事件对莲种胎脱水有积极的反应。在莲种胚脱水过程中，非酶促抗氧化剂和戊糖磷酸和维生素E作为主要的抗氧化剂，在脱水过程中维持荷花胚胎的REDOX平衡。这些结果为揭示荷花胚胎脱水保护机制的生理学调控网络提供了酶途径在抗氧化保护中起着主要作用。应激生理学检测表明，H2O2是诱发氧化应激损伤的主要活性氧（ROS）成分，谷胱甘肽新的见解。
iTRAQ标记定量蛋白组学技术研究方法：2021年7月，海南大学园艺园林学院吴友根教授课题组等在《Horticulture Research》期刊发表了题为“Integrative iTRAQ-based proteomic and transcriptomic analysis reveals the accumulation patterns of key metabolites associated with oilquality during seed ripening of Camellia oleifera”的研究成果，通过RNA测序(RNA-seq)和iTRAQ标记定量蛋白组学技术研究方法，发现了油茶种子成熟过程中与油质相关关键代谢产物的积累模式特征，探究了不同成熟度油茶转录组和蛋白质组谱机理，描绘了海南油茶种子成熟过程的动态变化图谱。为该树种的遗传改良提供了理论依据。定量蛋白质组学 蛋白质进行质谱检测未知蛋白进行全检测。
通过蛋白质组学分析检测了经M-Exos处理的HBMECs的改变。外泌体***了HBMECs，在0、24和48小时各种基因的表达增加(图2A)。此外，热图分析揭示了不同表达的功能基因，包括与炎症、细胞增殖、免疫调节和血管生成相关的因素(图2B-E)。时序分析表明，HBMECs中标记基因的上调与炎症因子IL3RA有关，增殖相关蛋白CD40和免疫调节因子TNFRSF10C(图2F-H)。作者主要研究外泌体是否促进人脑微血管内皮细胞的血管生成能力，因此初步验证了M-Exos***后血管生成相关基因的表达。蛋白质印迹结果显示血管生成相关基因FlK1和ANGPT1的表达明显增强(图2I)。综上所述，结果证实了M-Exos诱导了人脑微血管内皮细胞的功能改变。蛋白组学方案为组学研究涉及的样本获取,前处理,数据采集到分析的各个环节提供自动化。福建干眼蛋白组学
欧易鹿明生物蛋白质研究技术。福建干眼蛋白组学
为了验证TMT蛋白组学数据，作者选择了18个与莲种胚脱水保护功能密切相关的候选DEPs进行PRM蛋白靶向验证。PRM鉴定了18个候选DEPs。这些蛋白质的表达模式在PRM和TMT的定量结果之间显示出类似的趋势。然而，PRM检测到的蛋白丰度的倍数变化值要大于TMT数据。这一结果在很大程度上支持了TMT数据的可靠性。基于TMT标记定量蛋白质组学的生物信息学分析，对胁迫生理指标进行了测定，以验证莲种胚脱水的保护机制。在快速脱水阶段，REC和MDA含量的变化与RWC相反，它们的水平迅速增加（图6A，B）。ABA含量在快速脱水和脱水成熟阶段前略有增加（图6C）。上福建干眼蛋白组学
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