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浙江微生物代谢组学

来源: 发布时间:2022年09月06日

GC-MS非靶向代谢组学研究:不同分子量聚乙烯颗粒改变了玉米根际土壤微生物群落组成和代谢谱AlterationsoftherhizospheresoilmicrobialcommunitycompositionandmetaboliteprofilesofZeamaysbypolyethylene-particlesofdifferentmolecularweights研究对象:聚乙烯颗粒、玉米、根际土壤发表期刊:JournalofHazardousMaterials影响因子:10.588组学技术:GC-MS非靶向代谢组学和16SrRNA测序(由欧易/鹿明生物提供技术支持);这项研究的重点是确定不同分子量的PE颗粒干扰玉米生长和根际微环境的机制。本文运用非靶向代谢组学,微生物16SrRNA测序等方法研究的结果证实,不同分子量的PE颗粒对土壤-植物系统有不利影响。不同分子量的PE颗粒在形状和表面微观结构上存在明显差异。土壤蔗糖酶和过氧化物酶对不同分子量的PE颗粒有***响应。非靶向代谢组学数据分析 靶向代谢组学数据分析。浙江微生物代谢组学

非靶代谢组学研究:2022年03月,欧易/鹿明生物合作客户重庆医科大学附属第二医院消化内科周智航团队在International Journal of Biological Sciences期刊发表的题为 “Enhanced pentose phosphate pathway activity promotes pancreatic ductal adenocarcinoma progression via activating YAP/MMP1 axis under chronic acidosis”的研究成果,通过采用非靶代谢组学和基因表达芯片,发现了适应酸性微环境的胰腺导管腺* (PDAC)细胞具有更强的转移和增殖能力。


代谢组学显示适应酸性微环境的 PDAC 细胞中葡萄糖增加、糖酵解减少,而转录组学发现适应酸性微环境细胞中的差异表达基因主要为细胞外基质修饰和 Hippo 信号传导相关基因。MMP1 在在适应酸性微环境细胞中上调**为明显,实验验证了其由 YAP/TAZ 通路介导,而被 AMPK抑制。该研究确认了代谢重编程通过AMPK/ YAP /MMP1轴促进适应酸性微环境的 PDAC 细胞的增殖和转移。 浙江代谢组学 肥胖 检测代谢组学专业第三方检测,出具报告快,数据准。

代谢组学研究,2021年12月威尔康奈尔医学中心和纪念斯隆凯特琳**中心的Linda T. Vahdat 和 Vivek Mittal教授课题组在Nature Communications期刊发表的题为 “Copper depletion modulates mitochondrial oxidative phosphorylation to impair triple negative breast cancer metastasis”的研究成果,通过蛋白质组学和代谢组学研究方法,发现了高度转移性 SOX2/OCT4+ 细胞的离散亚群表现出细胞内铜水平升高特征,探究了TM 介导的复合物 IV 失活确定为 SOX2/OCT4+ 细胞群中的主要代谢缺陷,AMPK/mTORC1 能量传感器为重要的下游途径。描绘了铜-代谢-转移轴,为高风险三阴性乳腺*患者的下一代治疗方法提供了理论依据。

非靶向代谢组学研究:利用番茄的自然变异确定番茄复合体中果实多酚的途径结构和代谢调控ExploitingNaturalVariationinTomatotoDefinePathwayStructureandMetabolicRegulationofFruitPolyphenolicsintheLycopersicumComplex研究对象:番茄组织发表期刊:MolecularPlant影响因子:13.164组学技术:LC-MS靶向代谢组学、GC-MS非靶代谢组(双平台代谢组学),本研究通过表征构成八种不同番茄多酚代谢网络的潜在生物合成和修饰反应,阐明了八种番茄复合体多酚生物合成的整个生物合成框架,并对相关代谢物和结构基因进行了详细注释,并运用LC-MS/GC-MS双平台代谢组学方法为辅助育种提供帮助。此外,番茄果实成熟过程中的代谢变化为今后基于遗传的代谢工程设计提供了研究方向,并为研究其他重要植物物种中特定的代谢物的功能提供了理论依据。代谢组学-方法与应用-实验操作-仪器设备。

双平台代谢组学研究,2022年4月,鹿明生物合作客户中国医学科学院医药生物技术研究所李亮课题组在Environmental Pollution期刊发表了题为“Potential urinary biomarkers in young adults with short-term exposure to particulate matter and bioaerosols identified using an unbiased metabolomic approach”的研究成果,通过LC-MS+GC-MS双平台代谢组学研究方法,发现了空气中颗粒物和生物气溶胶暴露有关的尿液生物标志物,并揭示了循环暴露于清洁和污染空气环境的年轻健康人的尿液代谢特征的动态变化。鹿明生物技术支持及生信分析同事为该文章做出相应贡献,为署名作者。代谢组学 生物标志物挖掘**-欧易生物。浙江代谢组学氨基酸

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LC-MS非靶向代谢技术发现了粪便移植(FMT)对血液代谢的影响。标题:藻酸盐寡糖化小鼠的微生物群成功减轻了小肠粘膜炎期刊:MicrobiomeIF=14.650研究思路:*样本类型:小鼠小肠、肠道内容物、血浆*检测平台:LC-MS非靶向代谢组、转录组、16S微生物多样性检测等本研究发现藻酸盐寡糖(AOS)可以减轻***药物白消安诱导的小肠细胞膜的损伤,特别是细胞连接和微绒毛;并有利于肠道菌群变化进而改善小肠功能,提高肠道的免疫功能。LC-MS非靶向代谢技术发现了粪便移植(FMT)对血液代谢的影响,并分析了血液代谢物与肠道菌群之间的相关性,发现不同剂量的粪便移植对血液代谢组均产生了***影响,其中大部分是在小肠功能中起着重要作用的脂质代谢物,表明FMT可以在血液中恢复被白消安扰乱的代谢物。相关性分析表明,“有益菌”乳酸杆菌有助于血液代谢产物的恢复,“有害菌群”则不能协助血液代谢物的回收,揭示了FMT可改善小肠功能和肠道菌群,恢复血液代谢的原因。浙江微生物代谢组学

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