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上海欧易生物空间转录组报价

来源: 发布时间:2021年11月21日

空间转录组技术原理是什么?当组织冷冻切片附在空间转录组载片上时,条形码引物结合并从组织中捕获邻近的mRNA。被捕获的mRNA开始逆转录,得到的cDNA中包含了空间条形码。分析Illumina测序结果中空间条形码的序列,可以将每个mRNA转录的序列映射回组织切片中的起始位置。空间转录组的条形码逆转录oligo(dT)引物在显微镜载玻片表面的有序附着,空间转录组使得在mRNA样品处理和后续测序过程中位置信息的编码和获取成为可能。欧易生物具有上百例空间转录组项目执行经验,致力通过质量的服务,助力各位科研工作者取得新的突破。过真实研究案例聚焦包括单细胞转录组、单细胞基因组、单细胞代谢组、空间转录组。上海欧易生物空间转录组报价

本文利用空间转录组学研究了在AD小鼠模型中,淀粉样斑块周围直径为100mm的组织域中发生的转录变化。发现了富含髓鞘和少突胶质细胞基因(OLIGs)的基因共表达网络的早期改变,而斑块诱导的基因(PIGs)的多细胞基因共表达网络涉及补体系统、氧化应激、溶酶体和炎症,在疾病的后期非常突出。此外作者通过对小鼠和人脑切片进行原位测序(ISS),证实了大多数观察到的细胞水平的变化。空间转录组学分析为探究AD和其他脑部疾病致病特征附近失调的细胞网络提供了可能。江西实力空间转录组从实验到分析一站式掌握空间转录组流程及原理。

欧易生物高级技术支持陈老师首先给大家介绍了空间转录组学的发展历程、测序流程及原理。紧接着,欧易生物技术支持姚老师针对目前空间转录组学发表的一系列高分文章进行了方案设计的解析。姜老师给大家详细介绍了空间转录组项目样本准备、切片、贴片等实验过程及注意事项,并带领大家到实验室实地观摩了整个实验过程,并就其中细节进行了讲解。董老师针对空间转录组10x Space Ranger的分析原理及结果进行了详细解析,并介绍了使用Seurat包进行数据挖掘的标准分析流程。

空间转录组技术作为当今前沿的科研技术,相信很多老师都希望将其运用于自己的课题中,快速发表高分文章。欧易生物具有上百例空间转录组项目执行经验,致力通过质量的服务,助力各位科研工作者取得新的突破。由上海欧易生物医学科技有限公司(以下简称“欧易生物”)主办的“空间转录组学培训班”落下帷幕。培训中,欧易讲师团队以其丰富的项目经验及专业的生信能力,从空间转录组学的发展历程、测序原理、实验实操及数据挖掘等多维度,向远道而来的学员们展开了系统性的培训。


作者借助空间转录组测序技术探究人类心脏在发育过程中的基因表达特征和细胞图谱变化。

早期空间转录组学的另一条发展路线是基因捕获和增强子捕获筛选,开发于二十世纪八十年代,当时 DNA 测序通量正在增加,动物基因组是新开放的前沿领域。果蝇和小鼠的筛选是在八十年代后期进行的,目的是观察未靶向且通常未知的基因表达情况。随着通量的增加,增强子和基因捕获技术在九十年代成为空间转录组学的技术,直到 WMISH 在九十年代后期兴起。WMISH 技术的自动化程度较高,避免了对转基因品系的依赖,同时由于在二十一世纪初获得物种的参考基因组信息变得越来越便利,探针设计因此也更为方便。空间转录组使得我们在检测基因表达的同时获得基因在组织内部的空间位置信息。什么是空间转录组是什么

HE 染色适用于空间转录组的组织学呈现方法。上海欧易生物空间转录组报价

空间转录组的一般流程2。这使得在后续步骤中覆盖细胞组织图像和基因表达数据成为可能。用我们的渗透试剂对组织进行渗透,这意味着在细胞膜上形成小孔。RNA分子可以通过这些通道离开细胞,并与芯片上相邻的捕获探针结合。因此,基因表达信息被捕获在芯片上。需要通过以下步骤将捕获的RNA分子中存储的信息转换为数据。cDNA合成是为了创造稳定的双链DNA分子。这是必要的,因为cdna - rna -杂交体的降解速度很快。此外,这是构建可测序文库之前的必要步骤。所有之前收集的信息都被汇集起来,可以在线访问。这意味着在实践中,您可以查看组织切片的图像并选择组织中的不同区域。然后你可以确定哪些基因在这些区域中以什么数量表达。因此,你可以在一个单一的实验中进行新分析。上海欧易生物空间转录组报价

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