河南FabRICATORIdeS蛋白酶蛋白组学

与IdeS不同，融合蛋白是通过将两种或多种蛋白质或肽的功能组合成一个量身定制的分子来创造的，以专门应对挑战。连接此类蛋白质或肽结构域的常见方法是包含柔性连接子。这些连接子通常富含甘氨酸，例如甘氨酸残基（G），或甘氨酸残基散布丝氨酸残基（GS）以形成重复序列。这为连接子提供了足够的灵活性，不会干扰连接蛋白质结构域的功能。然而，这些新模式带来了新的分析挑战，需要新的工具来促进表征和产品质量监测。中级分析已成为分析单克隆抗体疗法的标准方法，涉及将分子消化成几个定义的亚基。它们足够小，可以获得高质量的质谱图，并为产品质量属性提供特定领域的信息。由于G和GS连接子对常见蛋白酶的降解具有抗性，因此很难分离结构域以进行深入分析。因此，Genovis开发了GlySERIAS，不同于IdeS酶，一种消化柔性富含甘氨酸的连接子的酶。GlySERIAS可以分离不同的功能域，并实现对融合蛋白、多特异性抗体和含有富含甘氨酸的连接子的各种mAb片段进行详细表征的中级方法。FabRICATOR（IdeS）酶是生物制药行业中普遍使用的工具。河南FabRICATORIdeS蛋白酶蛋白组学

对于涉及完整Fab或Fc抗体片段的应用，需要在抗体铰链处进行消化。木瓜蛋白酶和 Lys-C 等传统酶可用于生成 Fab 片段，但非特异性酶活性需要仔细优化，以极大限度地降低多个消化位点的风险。Genovis的SmartEnzymes IgG 蛋白酶 GingisKHAN 和 FabALACTICA 具有一个消化位点，可从人 IgG1 生成均质的 Fab 和 Fc 抗体片段。生成的片段可用于结晶和高阶结构 （HOS） 的 NMR 研究、结合研究等。在这里，我们提出了获得完整Fab和Fc抗体片段的不同策略。所得片段显示 GingisKHAN 的有效消化，用于生成完整的 Fab 片段或从依那西普上的融合 TNFR 结构域中分离 Fc。由于 GingisKHAN 的特异性消化依赖于 IgG 的天然折叠，因此在变性条件下特异性受到负面影响。为了使用SDS-PAGE分析消解效率，在加入SDS上样缓冲液之前，停止在分析样品中加入碘乙酰胺的反应。Genovis同时提供IdeS酶的纯化试剂盒。河北GingisREXIdeS蛋白酶可在铰链上方的一个特定位点消化人 IgA1，产生完整且均质的 Fab 和 Fc 片段。

Genovis提供冻干和固定化的FabRICATOR（IdeS），为客户提供了许多选择，以满足他们的需求。 冻干形式用于高度灵活的方法开发的目的，并随时准备使用，只需重组和添加到IgG样本。 冻干酶的灵活性也意味着它可以应用于更高的通量和自动化的工作流程。 Genovis还提供了在琼脂糖树脂上固定化的酶，在随时可用的旋转柱中，这可以极大限度地减少在样品中残留的酶，这可能是有利的。 对于更多的制备应用，我们提供FabRICATOR Fab2试剂盒，这是IgG片段生成和纯化的强大工具。 这包括FabRICATOR固定化柱和CaptureSelect Fc纯化柱，用于亚基的亲和纯化。 由于FabRICATOR在非还原条件下是活性的，F(ab’)2片段保留其链间和链内二硫键，如果片段想用于结合研究，这一点尤为重要，因为结合效率和免疫反应性将被保留。

其他基于 IgG 的生物制药需要仔细表征和监测关键质量属性，例如氧化、糖基化和其他翻译后修饰。与抗体的克隆选择、工艺开发和稳定性研究相关的大量样品通常通过液相色谱质谱 （LC-MS） 进行分析。然而，在LC-MS之前进行足够规模的样品制备通常具有挑战性。为了解决样品制备的挑战，Genovis将半胱氨酸蛋白酶FabRICATOR（IdeS）固定在磁性琼脂糖珠上，现在称为FabRICATOR MagIC。FabRICATOR固定在磁珠上，可同时快速自动消化多种抗体，促进中级表征工作流程。Genovis的FabRICATOR MagIC 如何以较少的用户交互减少实验和操作时间，降低样品处理错误的风险，同时提高通量。有助于监测多种CQA，例如糖基化、氧化和C端赖氨酸剪切。

抗体由于其大小和复杂性，是一种难以表征的分子。偶联药物有效载荷是对抗Ai症等疾病的一种有吸引力的方法，但进一步增加了异质性的复杂性和风险。抗体药物偶联物 （ADC） 需要像任何其他基于 IgG 的生物制药一样进行仔细和详细的表征，并且需要适当的分析工作流程。Genovis的FabRICATOR（IdeS）酶将ADC消化成其亚基，可以详细表征这类复杂的药物。Genovis的内切糖苷酶 IgGZERO和 GlycINATOR 还可以研究完整的 ADC，但降低复杂性并提高分辨率。可消化柔性富含甘氨酸的融合蛋白连接子，例如 Gly4Ser 和 GlyxSery （GS） 以及聚甘氨酸 （G） 接头。四川FabALACTICAIdeS蛋白酶

发现GingisREX精氨酸残基的特异性，Arg-C在赖氨酸和其他残基的非特异性。河南FabRICATORIdeS蛋白酶蛋白组学

与IdeS不同，Genovis的GingisREX（RgpB）是一种精氨酸特异性蛋白酶，可消化精氨酸残基的C末端蛋白质，包括难以与其他酶消化的Arg-Pro键。该酶可用于肽图分析、从头肽测序和翻译后修饰分析。精氨酸残基的特异性C-末端消化；在其他困难的精氨酸-脯氨酸序列中可靠消化；产生更长的肽-提高序列覆盖率。GingisREX是一种半胱氨酸蛋白酶，可特异性地消化肽键C末端到精氨酸残基，包括与脯氨酸相连的精氨酸。半胱氨酸是酶活性所必需的。与胰蛋白酶消化相比，可生成更长的肽，胰蛋白酶消化可以通过高分辨率质谱进行分离和鉴定。这为自下而上方法的样品制备提供了更多选择，以实现替代的酶解曲线和更高的序列覆盖率。GingisREX在赖氨酸上没有活性，通常使用Arg-C观察到。该酶在5.0-9.0的宽pH值范围内具有活性，它需要半胱氨酸并被盐酸胍抑制。该酶是从牙龈卟啉单胞菌中纯化的。河南FabRICATORIdeS蛋白酶蛋白组学