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河南消化道疾病菌群检测临床应用

来源: 发布时间:2024年05月23日

16SrRNA基因测序以细菌16SrRNA基因测序为主,主要是研究样品中的物种分类、物种丰度系统进化、功能预测以及微生物与环境互作关系等。16SrRNA基因是编码原核生物核糖体小亚基的基因,长度约为1542bp,其分子大小适中,突变率小,是细菌系统分类学研究中常用和有用的标志。16SrRNA基因序列包括9个可变区和10个保守区,保守区序列反映了物种间的亲缘关系,而可变区序列则能体现物种间的差异。16SrDNA是细菌染色体上编码16SrRNA相对应的DNA序列,16srRNA是由16srDNA转录来的,一般扩增检测和分析的对象都是16srDNA。而这一领域的研究进展,主要体现在菌群检测技术的发展和运用上。河南消化道疾病菌群检测临床应用

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过去的研究已鉴定出多个类风湿关节炎(RA)相关的基因突变,而肠道菌群是RA的环境风险因素之一。The Lancet Rheumatology上发表的一项横断面研究,在非RA患者中发现,并在RA高危受试者中验证,普氏菌属与RA的遗传风险明显相关,普氏菌属还与RA高危受试者的临床前期症状相关。①纳入1650名非RA双胞胎,基于233个GWAS鉴定出的RA相关SNP,评估受试者的RA多基因风险评分(PRS);②在6776名受试者(包括2686名RA患者)中,基于逻辑回归对RAPRS进行验证;③对受试者的粪便菌群进行测序,分析菌群与RAPRS的关联;④在非RA受试者中,普氏菌属与RAPRS呈明显正相关,在RA高危受试者(RA患者的直系亲属)中也存在这种关联;⑤另外,包括普氏菌属在内的7个菌属与RA的临床前期症状(ACPA或RF阳性等)相关。菌群检测肠道菌群--您所不知的“人体第二基因组”。

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AnnalsoftheRheumaticDiseases上发表的一项新研究,对类风湿关节炎(RA)患者及健康人的肠道菌群进行了宏基因组关联分析,鉴定出了一些与RA相关的菌种及菌群功能,并发现了一些具有人种特异性的RA相关的宏基因组-宿主基因组关联,提示宿主基因组、肠道菌群及RA的发病机制之间存在密切联系。①纳入82名类风湿关节炎(RA)患者及42名健康对照,对肠道菌群进行全基因组深度测序;②RA患者的肠道菌群宏基因组中,普氏菌属中多个菌种的丰度高于健康人;③RA患者的肠道菌群宏基因组中,R6FCZ7(与氧化还原反应相关的基因)的丰度明显低于健康人,而代谢相关通路(脂肪酸生物合成、粘多糖降解等)明显富集;④通过对比宏基因组关联分析(MWAS)与全基因组关联分析(GWAS),鉴定出一些RA相关的宏基因组-宿主基因组之间相关的通路。

    来自广东省中医院的黄闰月团队与黄清春团队在FrontiersinImmunology上发表的一项研究,对比了类风湿关节炎(RA)患者与健康对照的肠道菌群组成及功能差异,并对比了接受不同药物***后,RA患者的肠道菌群组成及功能的变化。①纳入22名RA患者及22名健康对照,13名患者接受化瘀强肾通痹方(HQT)+甲氨蝶呤,9名患者接受来氟米特(LEF)+甲氨蝶呤;②相比于健康对照,RA患者分别有的37个及21个肠道细菌物种富集或减少,维生素K2生物合成与RA患者中富集的细菌相关;③HQT组与LEF组患者的临床疗效相似,HQT影响红细胞沉降率,LEF影响C反应蛋白水平;④用药后,HQT组及LEF组患者分别有11个及4个肠道细菌物种,以及9个及2个菌群代谢通路发生变化。 专业肠道菌群检测请到上海沃本!

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业界有名的“慢性病肠源性学说”里,通过对几百个肥胖志愿者的检测,发现肠道菌群结构均出现紊乱,并提出“肠道菌群紊乱会导致肥胖”、“调整饮食结构重塑肠道菌群可以变瘦,从而避免慢性病的发生”等观点。研究发现,肠道菌群在肥胖人群与体重正常人群中具有明显差异,肠道内“肥胖菌”的含量往往能影响我们的体重。肠道菌群一方面可以通过调节代谢影响能量物质的吸收,另一方面能直接调控脂肪的代谢与储存,从而直接或间接的控制我们体内的脂肪含量。所以,“怎么吃都不胖”的人和“喝凉水都长肉”的人可能是由于肠道内细菌的差异。这些进步使我们能更好地理解菌群在人体健康中的重要地位,以及各种菌群失调可能引发的疾病。江苏亚健康人群菌群检测准确性高

肠道菌群决定您的心理健康?河南消化道疾病菌群检测临床应用

ArthritisandRheumatology上发表的一项研究,发现在关节炎小鼠模型及强直性脊柱炎患者中发生炎性小体的活化,后者与肠道菌群失调相关。而在关节炎小鼠模型中,炎性小体活化可驱动回肠炎的发生。①HLA-B27转基因小鼠的肠道NLRP3、NLRC4及AMI2表达增加,***处理可降低;②NLRP3抑制剂可预防凝胶多糖诱导的SKG小鼠的回肠炎,并延缓关节炎发病;③对比40名强直性脊柱炎(AS)患者及20名健康对照,AS患者回肠中的NLRP3、NLRC4、AIM2、Caspase-1、IL-1β及IL-18表达增加,且Caspase-1活性增加;④AS患者肠道菌群中的粘膜相关粘附侵袭细菌富集,并与PBMC中的炎性小体组分表达相关;⑤NLRP3表达与疾病活动度及IL-23A表达相关。河南消化道疾病菌群检测临床应用