鹿明生物空间代谢组学项目实测结果1、可实现代谢物定性数量：1000-3000个代谢物。2、定性代谢物类型：不喷涂基质，小分子物质检测不被基质抑制，定性物质约70%为700Da以下的小分子物质，30%为脂质大分子。空间多组学联合：空间代谢+空间转录2021年即拥有空间代谢组和空间转录组（欧易生物）两个平台，已执行空间代谢+空间转录联合项目10+。空间多组学检测平台2套AFADESI-MSI成像系统，分别连接QE或者QE-HF高分辨质谱仪。***套AFADESI成像系统（连接Thermo QE高分辨质谱仪）第二套AFADESI成像系统系统（连接Thermo QE-HF高分辨质谱仪）欧易生物空间代谢组学为广大研究者提供一站式服务。安徽空间代谢组学的质谱成像
本文作者开发的一种基于敞开式空气动力辅助解吸电喷雾离子化质谱成像（AFADESI-MSI）的空间代谢组学技术，可以实现大脑功能区域小分子极性代谢物的检测，发掘微区特定代谢途径的变化；结合代谢网络映射方法，对大鼠脑的代谢网络作图，并用于东莨菪碱***的阿尔茨海默病模型大脑微区的病理过程解析。这篇文章证实了空间代谢组学技术在神经学发展、行为与认知、精神与退行性疾病以及脑**研究领域的广泛应用前景。大脑的结构极为复杂，且主要功能区域的调节机制与小分子代谢物密切相关。基于色谱-质谱联用的传统代谢组学方法无法满足大脑复杂微区代谢物的定性、定量和定位表征的需求。福建空间代谢组学研究意义空间代谢组具有覆盖范围广,灵敏度高,动态范围宽。
1.AFADESI-MSI用于大脑中极性代谢物的定位如图1所示，将大鼠大脑连续矢状切面通过ESI探针对逐个像素进行扫描，并将解吸的代谢物离子传输到高分辨率质量分析仪进行分析。图1E是大鼠脑部某个像素点的一个代表性质谱图，在该图中可以观察到数千个代谢物的峰。AFADESI-MSI图像还表明脑部不同功能性区域中代谢物浓度的变化。图1A-D显示了代表性代谢产物图像，在松果体、纹状体、海马、胼胝体和嗅球等亚区域具有特定分布。这些异质代谢分布与大鼠脑的功能和结构复杂性高度一致。实验结果表明，AFADESI-MSI的空间分辨率小于100μm，代谢物质量比较大差异为0.001Da，同一物质的检测动态范围高达1000倍。如图1所示，通过AFADESI-MSI可在大鼠脑部检测到一些呈特征性分布有代表性的极性代谢物，其强度范围从0到104甚至到106。
空间代谢组学研究作者对P493-6B细胞淋巴瘤系（BCL）进行了全基因组表达谱、核突变和ChIP分析，发现MYC诱导增加了包括ACLY、ACACA、FASN和SCD1及其相关蛋白在内的脂肪酸（FA）合成基因的mRNA表达，在MYC诱导的肝细胞*（HCC）、急性白血病（T-ALL）和肾细胞*（RCC）的三种体内转基因小鼠模型中也有类似表达。还发现MYC与这些FA合成基因的启动子结合并启动mRNA转录，如甲羟戊酸和胆固醇途径基因的启动子。为了了解MYC和SREBP1之间的相互作用，作者首先，对这两种蛋白进行ChIP和re-ChIP分析，证明MYC和SREBP1都可以发现与FA合成基因启动子中的相同DNA分子结合（图1）。SREBP1的敲低也降低了FA合成基因的表达，但不降低MYC基因的表达。其次，ChIP的MYC与启动子结合，不仅调节FA合成基因的表达，还调节糖酵解和谷氨酰胺分解基因的表达。因此，MYC似乎会依次调节参与脂质合成的基因：首先诱导葡萄糖和谷氨酰胺，然后诱导FA合成相关基因。通过RNA测序（RNA-seq）发现，增加MYC水平会引起糖酵解、谷氨酰胺分解和FA合成。曾经错过热潮—空间转录组,别再错过新秀—空间代谢组。
空间代谢组学探究MYC、SREBP1与**发生的能量机制探索。斯坦福大学Dean W. Felsher课题组在Cell Metabolism发表的题为“The MYC Oncogene Cooperates with SterolRegulated Element-Binding Protein to Regulate Lipogenesis Essential for Neoplastic Growth”的研究成果，通过空间代谢组学、CHIP、RNA-seq、NMR和IHC等技术研究*基因MYC促进**发生机制，发现MYC与胆固醇调节元件结合蛋白（SREBP1）协同调节脂质生成，从而促进疾病的发生。中文标题：MYC*基因与固醇调节元件结合蛋白协同调节**生长所必需的脂肪生成研究对象：小鼠空间代谢组学找出其代谢物的差异,提供定量检测。广西空间代谢组学 药效物质
空间分辨代谢组学代谢组相关材料。安徽空间代谢组学的质谱成像
通过空间代谢组学检测到正常肾脏与MYC诱导的**之间的GPs丰度（m/z：700–1000），发现两组存在***差异，尤其是m/z在865的***增加。酰基侧链较短（18个碳或更少）的PG在MYC***的前15天呈现增加趋势，然后开始减少，但酰基侧链较长的PG含量持续增加（图 5）。MYC失活后，这些差异在很大程度上是可逆的。通过体外实验证明，MYC的诱导和MYC失活能够增加和降低了PG合成基因的mRNA（图6C）。并且MYC活化还上调了FA延长酶ELOVL2和ELOVL6的mRNA表达丰度（图6D）。结果显示，MYC参与调节FA生成和相关基因的表达。安徽空间代谢组学的质谱成像
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