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海南欧易生物酵母文库做什么

来源: 发布时间:2023年03月01日

酵母单杂交结果显示,磷酸盐饥饿响应因子OsPHR1/2/3可以***51个目标启动子中的25个,包括OsRAM1、OsRAD1、OsWRI5A等。OsRAM1、OsRAD1、OsWRI5A自身又可以调控许多菌根共生相关基因的表达(图A)。对丛枝菌根共生响应基因启动子序列预测分析显示,有78个转录因子被富集,87%的菌根共生响应基因受到OsPHR1/2/3的调控,其中42%受到OsPHR1/2/3的直接调控。因此推测OsPHR1/2/3可能是菌根共生调控网络中的一个关键调控枢纽(图A-B)。EMSA和荧光素酶报告实验证实,OsPHR12可以直接结合并***OsRAM1、OsWRI5A、OsPT11、OsAMT3启动子序列(图C-F),并且这种结合依赖于启动子中的P1BS元件(图G)。推出两套酵母双杂交文库构建体系MART体系。海南欧易生物酵母文库做什么

酵母单杂交筛选:(4)在筛选到的转录因子中,***GL1促进HIV-2转录。***GL1在免疫细胞中***表达,并与HIV的其他转录***因子,即Sp1、AP-1和PCAF/CBP/P300存在相互作用,本研究中显示HEK293T细胞中,***GL1过表达后,与LTR连接的萤火素酶表达上升近2倍,说明***GL1是一个转录***因子。值得一提的是,文章的背景介绍内容中,对应用其他技术(如RNAi、scRNA-seq、CRISPR等)对HIV转录调控方向的已有成果分析,发现这些方法为HIV-1的复制和潜伏期提供了见解,但并没有直接评估转录因子的结合和功能。文章中也对酵母单杂交技术与其他互作组技术(如Chip-seq、motif预测)进行了比较分析,发现eY1H技术对已识别因子的验证率为30-60%,同等或优于其他技术。河南技术酵母文库报价酵母文库酵母双杂交筛库个性化定制研究方案。

酵母文库筛选:为了系统地揭示调控丛枝菌根共生的转录因子,研究者以51个水稻基因的启动子为诱饵,利用包含1570个水稻全长转录因子的文库进行了酵母单杂交筛选。这51个基因主要是已报道的参与或调节菌根共生的基因。文库筛选发现了一个由266个转录因子和47个启动子高度连接的网络,称之为"丛枝菌根共生酵母单杂交网络(YAM)"。平均每个启动子可以和4个转录因子互作。266个转录因子分属至少11个转录因子家族。72%(192个)的YAM转录因子在根中存在表达(FPKM>1)。与非定殖根相比,19个YAM转录因子在丛枝菌根***定殖的根中表达上调。

通过酵母双杂交进行筛选,结果显示 SWC6 可以在蓝光下与 CRY1 相互作用(图 A-C)。同样,酵母双杂交实验显示 CRY2 也可以在蓝光下与 SWC6 相互作用(图 D)。并通过 pull-down、split-LUC、semi-in vivo pull-down、Co-IP 实验(图 E-L)证实 CRY1、CRY2 与 SWC6 的结合是蓝光依赖性的。SWC6 是真核生物中已报道的 SWR1 复合物亚基,负责催化 H2A.Z 在染色质上的替换。已报道 SWR1 复合物中 SWC6 可以与 ARP6 亚基结合。Pull-down、split-LUC、semi-in vivo pull-down、Co-IP 实验(图 A-H)显示,CRY1、CRY2 可以蓝光依赖性与 ARP6 结合。酵母结构及功能介绍酵母的应用 。

酵母双杂交、GSTpull-down实验显示,SWC6可以直接与HY5、HYH相互作用(图A-C)。pull-down实验显示ARP6同样可以与HY5、HYH相互作用(图D)。split-LUC、Co-IP实验证实HY5可以与SWC6、ARP6结合(图E-J)。下胚轴表型分析显示,蓝光下arp6hy5hyh三突变体下胚轴长度明显大于arp6突变体、hy5hyh双突变体,表明ARP6和HY5有可能通过不同途径调控下胚轴的发育。Semi-in vivo pull-down、Co-IP 实验显示,蓝光下,在 CRY1 存在下,SWC6 与 ARP6 的结合***增强。表明蓝光***的 CRY1 可能通过蓝光依赖的 CRY1-SWC6/ARP6 相互作用增强 SWC6 与 ARP6 的结合。酵母双杂交文库构建实验流程。甘肃发展酵母文库报价

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酵母文库实验:本研究报道了 OsNF-YB9 和 OsNF-YB7 在水稻中呈现亚功能化。OsNF-YB7 主要在胚中表达,而 OsNF-YB9 主要在发育中的胚乳中表达。在拟南芥 lec1-1 中异源表达 OsNF-YB9  OsNF-YB7 可以弥补 lec1-1 缺陷。OsNF-YB9 功能缺失导致种子发育异常,种子变长、变窄、变薄,垩白率较高。此外,osnf-yb9 中淀粉合成相关基因的表达紊乱。OsNF-YB9 可以与主要在水稻胚乳中表达的蔗糖合酶蛋白激酶 SPK 相互作用。spk 敲除突变体种子与 osnf-yb9 突变体种子都表现出垩白增加的表型。OsNF-YB9 在水稻和拟南芥中的异位表达导致了种子变小。综上表明,OsNF-YB9 在水稻种子发育中起到关键调控作用。海南欧易生物酵母文库做什么

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