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天津植物冷冻切片与空间代谢组学

来源: 发布时间:2023年02月06日

空间代谢组的成像。生成空间代谢组谱图和拉曼相关图,从而能够将振动光谱检测到的结构特征分配给通过质谱检测到的单个分子物种(图3D,E)。一般说来,数据显示了与多种不同脂质相关的拉曼振动峰之间的高度相关性。由于可以获得很好的相关性,作者随后对拉曼光谱和质谱进行了PLS多元回归。用作为例子,作者回归了m/z844.52pC(38:6)的拉曼光谱。回归载体显示高度特异的脂峰,表明对磷脂酰胆碱具有特异性(图3F)。回归分析表明,可建立高度线性关系(校正R2=0.825)(图3G)。假设在一级近似下质谱与浓度的线性关系,这个基于拉曼的模型可以作为复杂组织中特定脂质种类的预测因子。这些结果**了使用基于结构和生物分子信息的互补光谱模式的脂肪组谱的新证明。质谱成像空间代谢组学方法及其应用研究进展。天津植物冷冻切片与空间代谢组学

分子成像技术是研究大脑中DNA、RNA、蛋白质和代谢产物的强大工具。质谱成像技术(MSI)是一种检测大脑中蛋白质、代谢物和脂质物质的高灵敏度和高通量分子成像技术,在**边缘诊断、**生物标志物发现、药物分布和机理阐述等领域有***的应用。本文作者开发了一种基于敞开式空气动力辅助解吸电喷雾离子化质谱成像(AFADESI-MSI)技术的代谢网络映射方法,对大鼠脑不同极性的小分子代谢物(m/z50-500Da)进行微区分布研究,不仅鉴定出脑部几乎所有重要的代谢物,还绘制了包含神经递质、嘌呤,有机酸,多胺,胆碱、碳水化合物和脂类等20条通路的代谢网络,并使用这种代谢网络映射质谱成像方法解析了东莨菪碱致大鼠记忆功能障碍模型脑的代谢变化,为***系统疾病的***提供新的信息和见解。云南空间代谢组学的质谱成像鹿明生物购入空间代谢组学,并构建深度空间代谢组学的完整解决方案。

本文作者开发的一种基于敞开式空气动力辅助解吸电喷雾离子化质谱成像(AFADESI-MSI)的空间代谢组学技术,可以实现大脑功能区域小分子极性代谢物的检测,发掘微区特定代谢途径的变化;结合代谢网络映射方法,对大鼠脑的代谢网络作图,并用于东莨菪碱***的阿尔茨海默病模型大脑微区的病理过程解析。这篇文章证实了空间代谢组学技术在神经学发展、行为与认知、精神与退行性疾病以及脑**研究领域的广泛应用前景。大脑的结构极为复杂,且主要功能区域的调节机制与小分子代谢物密切相关。基于色谱-质谱联用的传统代谢组学方法无法满足大脑复杂微区代谢物的定性、定量和定位表征的需求。

空间代谢组学研究作者对P493-6B细胞淋巴瘤系(BCL)进行了全基因组表达谱、核突变和ChIP分析,发现MYC诱导增加了包括ACLY、ACACA、FASN和SCD1及其相关蛋白在内的脂肪酸(FA)合成基因的mRNA表达,在MYC诱导的肝细胞*(HCC)、急性白血病(T-ALL)和肾细胞*(RCC)的三种体内转基因小鼠模型中也有类似表达。还发现MYC与这些FA合成基因的启动子结合并启动mRNA转录,如甲羟戊酸和胆固醇途径基因的启动子。为了了解MYC和SREBP1之间的相互作用,作者首先,对这两种蛋白进行ChIP和re-ChIP分析,证明MYC和SREBP1都可以发现与FA合成基因启动子中的相同DNA分子结合(图1)。SREBP1的敲低也降低了FA合成基因的表达,但不降低MYC基因的表达。其次,ChIP的MYC与启动子结合,不仅调节FA合成基因的表达,还调节糖酵解和谷氨酰胺分解基因的表达。因此,MYC似乎会依次调节参与脂质合成的基因:首先诱导葡萄糖和谷氨酰胺,然后诱导FA合成相关基因。通过RNA测序(RNA-seq)发现,增加MYC水平会引起糖酵解、谷氨酰胺分解和FA合成。鹿明生物是国内早期推出AFADESI-MSI空间代谢组技术服务的先导者。

在获得AFADESI平台原创团队全力支持下,截止2021年9月,鹿明生物已经完成共计近千例样本经验,包括心脏、脑、**、肠道、肝脏、肾脏、皮肤等十几种组织样本空间代谢组学检测及分析,检测物质涵盖胆碱类、多胺类、氨基酸类、肉碱类、核苷类、核苷酸类、有机酸类、碳水化合物类、胆固醇类、胆酸类、脂质类等多种类代谢物。欢迎各老师咨询~空间多组学检测平台2套AFADESI-MSI成像系统,分别连接QE或者QE-HF高分辨质谱仪。欧易生物、鹿明生物2021年即拥有空间代谢组和空间转录组(欧易生物)两个平台,已执行空间代谢+空间转录联合项目10+。空间代谢组特异性强等优点。陕西空间代谢组学和心脏

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AFADESI-MSI空间代谢组学:生物组织**能代谢物的空间分布可以更深层次的理解组织特异性分子组织学和病理学。问题的**在于开发一种非靶向、高灵敏度、高覆盖和高特异性的成像方法,能够可视化大量代谢产物在其自然状态下的空间分布。将功能代谢物的空间和时间变化与组织结构和生物功能联系起来,从根本上解释组织在分子水平上发生了什么。AFADESI-MSI 是一种高灵敏、高覆盖、宽动态范围、强特异性的组织代谢物成像分析技术,灵敏度可达到 pg 级,且代谢物含量动态范围跨越 3 个数量级,实现了组织微区的精确表征和质量数相近代谢物的准确识别,可对组织大小为 1 mm×1 mm~1.5 cm×3.5 cm 的样本进行代谢物空间成像分析。天津植物冷冻切片与空间代谢组学

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