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河北品质酵母文库

来源: 发布时间:2023年02月03日

通过传统的酵母双杂交系统,以PtDAL1为诱饵,筛选样本来源于不同年龄段的油松cDNA文库。将获得的阳性克隆,10个一组,挑选到1个96孔板的PCR板孔中,获得10*96个阳性克隆的96孔板。以其中阳性克隆mix为模板,进行PCR扩增,并将所有的PCR产物进行纯化。使用纯化后的PCR产物,进行打断后构建二代测序文库,通过NGS测序,获得6G的阳性克隆数据。通过分析二代测序数据,获得阳性克隆基因信息(去冗余后获得135个互作子,包含21个TFs,2个TRs及酶类、热激蛋白、RNA结合等蛋白,部分见表1)。挑选重要的候选基因进行一对一验证(图2)。与拟南芥中同源基因AGL6的蛋白互作网络进行比对分析。对DAL1互作蛋白(DIPs)的基因表达谱、启动子中的顺势作用元件功能进行分析,并对DIPs进行GO注释(图3)。综合生信分析结果,构建针叶树老化途径的调控模型(图4)。文库质粒与酵母文库载体重组。河北品质酵母文库

酵母单杂交测试:为验证该文库在Y2H和Y1H体系中的有效性,作者以OsMADS1为诱饵筛选水稻转录因子文库,进行了酵母双杂交测试。以Ghd7的启动子片段为诱饵,进行了酵母单杂交测试。结果显示我们的水稻转录因子文库可以有效且高通量的检测蛋白-水稻TF、DNA-水稻TF间的相互作用。另外,该研究中指出,使用该文库筛选鉴定蛋白-TF互作,采用mating法较为方便,即Y2HGold-Bait诱饵菌液与Y187-TF文库菌液一对一杂交。而筛选鉴定DNA-TF互作,采用Y1HGold系统,即Y1HGold-pomoter筛选TF文库质粒更简单高效。此外,可通过降低筛选压力处理,进行弱相互作用的检测。吉林品质酵母文库报价酵母双杂交技术服务酵母双杂交文库构建。

酵母文库实验:本研究发现了一个硝酸盐响应的 BTB/TAZ 蛋白 MdBT2,它参与调节硝酸盐介导的苹果植株生长。利用酵母双杂交、蛋白质 pull-down、BiFC 实验证实,MdBT2 可以与一个 DELLA 蛋白 MdRGL3a 互作,这种互作是 MdRGL3a 蛋白经由 26S 蛋白酶体途径的泛素化及降解所必需的。此外,异源表达 MdBT2 部分回复了 MdRGL3a 过表达所导致的拟南芥生长抑制。综上表明,MdBT2 可以通过降低 DELLA 蛋白 MdRGL3a 的丰度促进硝酸盐介导的植物生长。实验室培养显示,培养 45 天,苹果幼苗的高度和生物量随硝酸盐浓度的增加而增加(图 A-C)。

利用酵母双杂交技术进行筛选,结果显示SP8可以与水稻OsMYC3蛋白相互作用,并且二者互作关系通过酵母一对一互作、BiFC、Co-IP、LCI实验得以验证(图A-C)。利用截短的SP8进行酵母一对一互作和Co-IP检测表明,与OsMYC3的结合依赖于SP8的NTP结构域(图D-E);同样,OsMYC3的TAD结构域也是二者互作所必不可少的(图F)。酵母双杂交、BiFC实验表明,OsMYC3可以与OsJAZ相互作用。经茉莉酸处理,野生对照株根的长度明显被抑制、一系列JA生物合成和信号传导相关基因表达量上升,但Osmyc3突变体中抑制程度减轻、JA相关基因表达量上升减少。酵母双杂交文库构建实验流程。

酵母文库实验:本研究报道了 OsNF-YB9 和 OsNF-YB7 在水稻中呈现亚功能化。OsNF-YB7 主要在胚中表达,而 OsNF-YB9 主要在发育中的胚乳中表达。在拟南芥 lec1-1 中异源表达 OsNF-YB9  OsNF-YB7 可以弥补 lec1-1 缺陷。OsNF-YB9 功能缺失导致种子发育异常,种子变长、变窄、变薄,垩白率较高。此外,osnf-yb9 中淀粉合成相关基因的表达紊乱。OsNF-YB9 可以与主要在水稻胚乳中表达的蔗糖合酶蛋白激酶 SPK 相互作用。spk 敲除突变体种子与 osnf-yb9 突变体种子都表现出垩白增加的表型。OsNF-YB9 在水稻和拟南芥中的异位表达导致了种子变小。综上表明,OsNF-YB9 在水稻种子发育中起到关键调控作用。酵母文库筛库欧易生物。河南发展酵母文库

博士期间长期从事酵母单/双杂交文库构建及筛选的工作。河北品质酵母文库

酵母单杂交筛选:(4)在筛选到的转录因子中,***GL1促进HIV-2转录。***GL1在免疫细胞中***表达,并与HIV的其他转录***因子,即Sp1、AP-1和PCAF/CBP/P300存在相互作用,本研究中显示HEK293T细胞中,***GL1过表达后,与LTR连接的萤火素酶表达上升近2倍,说明***GL1是一个转录***因子。值得一提的是,文章的背景介绍内容中,对应用其他技术(如RNAi、scRNA-seq、CRISPR等)对HIV转录调控方向的已有成果分析,发现这些方法为HIV-1的复制和潜伏期提供了见解,但并没有直接评估转录因子的结合和功能。文章中也对酵母单杂交技术与其他互作组技术(如Chip-seq、motif预测)进行了比较分析,发现eY1H技术对已识别因子的验证率为30-60%,同等或优于其他技术。河北品质酵母文库

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