空间代谢组学研究作者对P493-6B细胞淋巴瘤系（BCL）进行了全基因组表达谱、核突变和ChIP分析，发现MYC诱导增加了包括ACLY、ACACA、FASN和SCD1及其相关蛋白在内的脂肪酸（FA）合成基因的mRNA表达，在MYC诱导的肝细胞*（HCC）、急性白血病（T-ALL）和肾细胞*（RCC）的三种体内转基因小鼠模型中也有类似表达。还发现MYC与这些FA合成基因的启动子结合并启动mRNA转录，如甲羟戊酸和胆固醇途径基因的启动子。为了了解MYC和SREBP1之间的相互作用，作者首先，对这两种蛋白进行ChIP和re-ChIP分析，证明MYC和SREBP1都可以发现与FA合成基因启动子中的相同DNA分子结合（图1）。SREBP1的敲低也降低了FA合成基因的表达，但不降低MYC基因的表达。其次，ChIP的MYC与启动子结合，不仅调节FA合成基因的表达，还调节糖酵解和谷氨酰胺分解基因的表达。因此，MYC似乎会依次调节参与脂质合成的基因：首先诱导葡萄糖和谷氨酰胺，然后诱导FA合成相关基因。通过RNA测序（RNA-seq）发现，增加MYC水平会引起糖酵解、谷氨酰胺分解和FA合成。空间代谢组三个维度的分析。上海深度空间代谢组学是靶向代谢组吗
空间代谢组学：在大鼠脑绘制特定区域分布的极性代谢物图谱使用AFADESI-MSI在正离子和负离子模式下分别获得298个和372个微区轮廓清晰的代谢物离子图像。使用精确分子量并结合同位素丰度，通过人类代谢组数据库（HMDB）对离子图像进行识别，鉴定出多种内源极性代谢物，包括氨基酸、核苷酸或核苷、碳水化合物、脂肪酸和神经递质等。***系统（CNS）的特定功能和特定解剖区域相关。例如，乙酰胆碱在大脑皮层中高度表达；γ-氨基丁酸是一种抑制性神经递质，其在大脑皮层的信号强度较低，在中脑、嗅球和下丘脑中的浓度较高。江苏空间代谢组学优势空间代谢组学,代谢组数据库。
空间代谢组学：伦敦帝国理工学院George B Hanna教授团队及合作者在《Cancer Research》发表了题为“De novo lipogenesis alters the phospholipidome of esophageal adenocarcinoma"的研究成果，该研究整合磷脂代谢组学、空间代谢组学和遗传学方法，旨在阐明食管腺*的磷脂代谢重编程，对探索与疾病诊断相关的磷脂生物标志物具有重要意义。中文标题：脂质从头合成改变食管腺*磷脂代谢研究对象：食管腺*发表期刊：CancerResearch影响因子：12.701发表单位：伦敦帝国理工学院运用生物技术：空间代谢组学
空间代谢组学：a）小鼠脑冠状切片图像显示亮场图像和拉曼光谱图像（b）脂质，蛋白质和DNA的拉曼光谱覆盖层（c）髓鞘结合蛋白(MBP)、Tuj1(III类β-微管蛋白)和4'，6-二氨基-2-苯基吲哚(DAPI)的代表性染色（d）小鼠大脑感兴趣区域的高分辨率显微拉曼图像(200×200μm)，显示与脂类(2885cm−1)、蛋白质(2940cm−1)和DNA(3000cm−1)相关的拉曼光谱峰（e）K-means聚类(n=2个聚类)显示不同的脑组织特征（f）与twok-means团簇相关的**平均拉曼光谱（g）根据m/z848.63和m/z844.52，主要髓鞘的空间代谢组成像显示灰质和白质分离，推测为Cer(D18：1/24：1)和PC(38：6)（h）灰质和白质的代表性的平均空间代谢质谱图(分别以绿色和红色表示) 空间代谢组学研究应用前景广阔。
空间代谢组学：质谱成像方法提供了一种直接获取代谢网络信息的途径，以系统地深入了解大脑的代谢活动。基于KEGG数据库的Metaboanalyst软件进行代谢网络分析。共找到20条KEGG代谢通路，包含126个具有微区信息的代谢物，图2显示了涉及丙氨酸-天冬氨酸和谷氨酸代谢、花生四烯酸代谢、精氨酸和脯氨酸代谢、肌酸途径、GABA能突触、葡萄糖代谢、谷胱甘肽代谢、甘油磷脂代谢、甘氨酸-丝氨酸和苏氨酸的代谢、组氨酸代谢、赖氨酸代谢、苯丙氨酸代谢、多胺代谢途径、嘌呤代谢、嘧啶代谢和TCA循环、色氨酸代谢、酪氨酸代谢、缬氨酸-亮氨酸和异亮氨酸代谢和类固醇***合成途径。空间代谢组技术流程 。湖北植物冷冻切片与空间代谢组学
空间代谢组特异性强等优点。上海深度空间代谢组学是靶向代谢组吗
AFADESI-MSI空间代谢组学：生物组织**能代谢物的空间分布可以更深层次的理解组织特异性分子组织学和病理学。问题的**在于开发一种非靶向、高灵敏度、高覆盖和高特异性的成像方法，能够可视化大量代谢产物在其自然状态下的空间分布。将功能代谢物的空间和时间变化与组织结构和生物功能联系起来，从根本上解释组织在分子水平上发生了什么。AFADESI-MSI 是一种高灵敏、高覆盖、宽动态范围、强特异性的组织代谢物成像分析技术，灵敏度可达到 pg 级，且代谢物含量动态范围跨越 3 个数量级，实现了组织微区的精确表征和质量数相近代谢物的准确识别，可对组织大小为 1 mm×1 mm~1.5 cm×3.5 cm 的样本进行代谢物空间成像分析。上海深度空间代谢组学是靶向代谢组吗
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