代谢组学+转录组学研究：2022年2月，中国海洋大学食品科学与工程学院刘尊英教授课题组在《Foods》期刊发表的题为“Dissecting of the AI-2/LuxS Mediated Growth Characteristics and Bacteriostatic Ability of Lactiplantibacillus plantarum SS-128 by Integration of Transcriptomics and Metabolomics”的研究成果，通过转录组学和代谢组学等研究方法，发现植物乳孢杆菌可以通过AI-2/luxs介导的群体感应(QS)系统来调节其生长特性和代谢，该系统是参与食品安全的正调控因子，这将有助于研究植物乳孢杆菌的生物保护控制潜力，特别是在食品工业生物技术中的应用。非靶向代谢组学，靶向代谢组学研究经验。北京检测机构代谢组学
GC-MS非靶向代谢组学研究：不同分子量聚乙烯颗粒改变了玉米根际土壤微生物群落组成和代谢谱AlterationsoftherhizospheresoilmicrobialcommunitycompositionandmetaboliteprofilesofZeamaysbypolyethylene-particlesofdifferentmolecularweights研究对象：聚乙烯颗粒、玉米、根际土壤发表期刊：JournalofHazardousMaterials影响因子：10.588组学技术：GC-MS非靶向代谢组学和16SrRNA测序(由欧易/鹿明生物提供技术支持)；这项研究的重点是确定不同分子量的PE颗粒干扰玉米生长和根际微环境的机制。本文运用非靶向代谢组学，微生物16SrRNA测序等方法研究的结果证实，不同分子量的PE颗粒对土壤-植物系统有不利影响。不同分子量的PE颗粒在形状和表面微观结构上存在明显差异。土壤蔗糖酶和过氧化物酶对不同分子量的PE颗粒有***响应。浙江代谢组学标本收集欧易生物/鹿明生物提供专业的靶向代谢组学服务。
作者研究发现**酸过量会导致葡萄酒颜色变浅，但**酸干扰对酵母细胞繁殖和β-葡萄糖苷酶活性均无***影响，随后通过非靶代谢组学、靶向代谢组学等技术研究**酸干扰过程中葡萄酒代谢物的变化，发现**酸过量会干扰酒精发酵过程中花青素的代谢，通过加速其异构化来削弱花青素浓度，从而影响葡萄酒色泽，因而在葡萄酒生产中过程中应避免**酸过量。通过非靶代谢组学技术，能够了解发酵过程中，发酵液代谢物的变化情况。了解到在糖酵解过程中，多余的PA会扰乱糖酵解和三羧酸循环的过程，从而深入了解葡萄酒发酵过程中颜色变化的原因。上海鹿明生物科技有限公司多年来，一直专注于生命科学和生命技术领域，是国内早期开展以蛋白组和代谢组为基础的多层组学整合实验与分析的团队。目前鹿明生物在顶空代谢组学研究已经有了成熟的技术方法和多项项目经验。
LC-MS非靶向代谢技术发现了粪便移植（FMT）对血液代谢的影响。标题：藻酸盐寡糖化小鼠的微生物群成功减轻了小肠粘膜炎期刊：MicrobiomeIF=14.650研究思路：*样本类型：小鼠小肠、肠道内容物、血浆*检测平台：LC-MS非靶向代谢组、转录组、16S微生物多样性检测等本研究发现藻酸盐寡糖（AOS）可以减轻***药物白消安诱导的小肠细胞膜的损伤，特别是细胞连接和微绒毛；并有利于肠道菌群变化进而改善小肠功能，提高肠道的免疫功能。LC-MS非靶向代谢技术发现了粪便移植（FMT）对血液代谢的影响，并分析了血液代谢物与肠道菌群之间的相关性，发现不同剂量的粪便移植对血液代谢组均产生了***影响，其中大部分是在小肠功能中起着重要作用的脂质代谢物，表明FMT可以在血液中恢复被白消安扰乱的代谢物。相关性分析表明，“有益菌”乳酸杆菌有助于血液代谢产物的恢复，“有害菌群”则不能协助血液代谢物的回收，揭示了FMT可改善小肠功能和肠道菌群，恢复血液代谢的原因。代谢组学真正反映业已发生得变化。
尿液代谢组学研究案例，空气中PM和生物气溶胶共同暴露的尿液代谢组学特征采用LC-MS+GC-MS双平台代谢组学方法对尿液样品进行分析，其中GC-MS检测102种代谢物，LC-MS检测到1271种。作者通过使用亚组来分析差异代谢物是否具有性别或季节性，结果表明性别和季节对本研究的结果没有明显的混杂影响。差异分析表明，Pu1和Po1之间的差异代谢物数量大于Po1和C之间的差异，LC-MS分析比GC-MS分析检测到更多的差异代谢物，体现出不同平台的检测特点。为了确定尿液中与空气污染PM暴露相关的代谢生物标志物，使用综合分析获得候选差异代谢物，其中C-Po1和Po1-Pu1比较中的重叠差异代谢物作为短期PM暴露相关标志物，确定了33种与短期暴露于空气污染相关的差异代谢物，包括8种脂质、6种核酸、7种氨基酸及其衍生物、3种葡萄糖和9种其他代谢物。KEGG通路分析表明，***富集到5种代谢通路，与免疫、炎症、人类的环境压力、缺血和缺氧有关。代谢组学——研究对象大都是相对分子质量1000以内的小分子物质。浙江核磁共振代谢组学
以代谢组学为研究对象，探究细胞、组织或其变化规律的科学。北京检测机构代谢组学
本研究通过LC-MS和GC-MS双平台代谢组学研究方法，对92例样品5个时间点的尿液样品进行分析，分别找到了33种和155种与PM和生物气溶胶相关的差异标志物，结果揭示了年轻健康人在五个不同时间点的尿液代谢谱的动态变化，采用KEGG通路富集分析和时间序列分析确定了与短期共同暴露于空气中PM和生物气溶胶相关的几种潜在代谢物生物标志物，发现短期高浓度暴露于PM可能会导致代谢改变并降低应激***水平，这可能是与下丘脑-垂体-肾上腺和交感-肾上腺-髓质轴的***有关；而生物气溶胶剂则通过***系统对病理性成瘾有重要作用。其中尿液中的16-脱氢孕酮可能是PM暴露的潜在生物标志物；4-羟基苯乙醇可能是生物气溶胶的潜在生物标志物，可用于分别预测或诊断PM或生物气溶胶相关疾病。北京检测机构代谢组学
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