尿液代谢组学研究案例，空气中PM和生物气溶胶共同暴露的尿液代谢组学特征采用LC-MS+GC-MS双平台代谢组学方法对尿液样品进行分析，其中GC-MS检测102种代谢物，LC-MS检测到1271种。作者通过使用亚组来分析差异代谢物是否具有性别或季节性，结果表明性别和季节对本研究的结果没有明显的混杂影响。差异分析表明，Pu1和Po1之间的差异代谢物数量大于Po1和C之间的差异，LC-MS分析比GC-MS分析检测到更多的差异代谢物，体现出不同平台的检测特点。为了确定尿液中与空气污染PM暴露相关的代谢生物标志物，使用综合分析获得候选差异代谢物，其中C-Po1和Po1-Pu1比较中的重叠差异代谢物作为短期PM暴露相关标志物，确定了33种与短期暴露于空气污染相关的差异代谢物，包括8种脂质、6种核酸、7种氨基酸及其衍生物、3种葡萄糖和9种其他代谢物。KEGG通路分析表明，***富集到5种代谢通路，与免疫、炎症、人类的环境压力、缺血和缺氧有关。非靶向代谢组学数据分析 靶向代谢组学数据分析。北京代谢组学 方法与应用
非靶向代谢组学研究：通过在三个成熟阶段收获两个东方甜瓜品种的果实作者使用非靶代谢组学联合转录组学发现可溶性糖和有机酸在转录组水平和代谢组水平的差异现象。这项研究运用多组学技术联合揭示了两个品种成熟过程中关键的代谢和转录特征。在本研究中，通过代谢和转录组分析的综合分析，研究了控制两个东方甜瓜品种'甜宝'和'小翠瓜'中糖和有机酸代谢的基因网络。筛选了与糖和有机酸代谢相关的关键代谢物和候选基因，并讨论了甜瓜品种甜度不同的可能解释。研究结果提高了对决定甜瓜发育和成熟过程中糖和有机酸积累和代谢的分子机制的理解。上海代谢组学 英文基于 LC-MS/GC-MS代谢组学 从样本采集到数据分析。
非靶向GC-MS代谢组学、LC-MS代谢组学研究标题：中国浓香白酒生产过程中人工窖泥中原核生物群落的结构和功能变化研究对象：浓香白酒、人工窖泥期刊：mSystems影响因子：6.469发表时间：2020年3月合作单位：四川省农业科学院水稻高粱研究所运用欧易/鹿明生物技术：TMT标记定量蛋白质组学、PRM靶向验证、非靶向GC-MS代谢组学、LC-MS代谢组学、16SrRNA测序，本篇非靶向代谢组学分析共鉴定出7,478种代谢物。GC-MS代谢组学和LC-MS代谢组学方法在OP***A中均可明确分离批次（图5a至d）。在第四批人工窖泥样品中，分别上调和下调了491和523种代谢物。差异代谢产物被分为16个功能类别（图5f）。脂质和类脂质分子（38.07%）**多，其次是有机杂环化合物（16.17%）和有机酸及其衍生物（13.11%）。
代谢组学等多组学研究，2021年12月30日复旦大学附属中山医院樊嘉院士、中国科学院上海药物研究所周虎研究员、中国科学院分子细胞科学***创新中心高大明研究员、复旦大学附属中山医院**教授课题组合作在Cancer Cell上发表题为“Proteogenomic characterization identifies clinically relevant subgroups of intrahepatic cholangiocarcinoma”的研究论文，通过基因组学、转录组学、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、微生物组学研究方法对262例肝内胆管*（iCCA）患者的配对**和*旁组织进行了分析，通过绘制肝内胆管*的多维分子图谱为进一步鉴定iCCA的分子发病机制、分子分型、预后等提供了宝贵的资源。非靶向代谢组学 土壤非靶代谢学 非靶脂质组学研究。
高通量代谢组学研究,中文标题：高通量代谢组学方法发现***羊藿提取物对骨质疏松症影响的代谢生物标志物及途径发表期刊：Frontiersinpharmacology影响因子：5.810发表时间：2020年8月发表单位：南昌大学***附属医院运用组学技术：超高效液相色谱法结合四极杆飞行时间质谱法技术（UPLC-Q-TOF/MS）代谢组学。本研究采用UPLC-Q-TOF/MS代谢组学对OP模型中的大鼠和不同剂量Ext-epi处理的大鼠进行分析，从大鼠血清代谢组学和标志物相关代谢途径中揭示了46种潜在生物。不同剂量组的Ext-epi对16种潜在的生物标志物具有***的逆转作用，涉及三种主要的代谢途径，其中ZL-IL的***效果相对稳定，组间聚类比较明显，该剂量可被视为进一步研究的更好剂量。本研究从代谢组学水平评估了Ext-epi对OP的预防和***效果，为开发Ext-epi***OP提供了依据，也为开发OP***提取物提供了参考。靶向代谢组学、非靶向代谢组学在线咨询。浙江代谢组学手册 电子版
非靶向代谢组学 土壤非靶向代谢组学 脂质组学研究。北京代谢组学 方法与应用
非靶向代谢组学研究：2022年5月，欧易/鹿明生物合作客户甘肃省农业科学院程鸿团队和中国农业大学林涛团队在Frontiers in Plant Science期刊发表的题为 “Identification of Key Gene Networks Controlling Soluble Sugar and Organic Acid Metabolism During Oriental Melon Fruit Development by Integrated Analysis of Metabolic and Transcriptomic Analyses”的研究成果，采用非靶代谢组学和转录组研究方法，发现了蔗糖、D-葡萄糖、棉子糖的高积累以及相对较低的柠檬酸和苹果酸可能有助于东方甜瓜“甜宝”的甜味。北京代谢组学 方法与应用
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