尿液代谢组学研究案例，空气中PM和生物气溶胶共同暴露的尿液代谢组学特征采用LC-MS+GC-MS双平台代谢组学方法对尿液样品进行分析，其中GC-MS检测102种代谢物，LC-MS检测到1271种。作者通过使用亚组来分析差异代谢物是否具有性别或季节性，结果表明性别和季节对本研究的结果没有明显的混杂影响。差异分析表明，Pu1和Po1之间的差异代谢物数量大于Po1和C之间的差异，LC-MS分析比GC-MS分析检测到更多的差异代谢物，体现出不同平台的检测特点。为了确定尿液中与空气污染PM暴露相关的代谢生物标志物，使用综合分析获得候选差异代谢物，其中C-Po1和Po1-Pu1比较中的重叠差异代谢物作为短期PM暴露相关标志物，确定了33种与短期暴露于空气污染相关的差异代谢物，包括8种脂质、6种核酸、7种氨基酸及其衍生物、3种葡萄糖和9种其他代谢物。KEGG通路分析表明，***富集到5种代谢通路，与免疫、炎症、人类的环境压力、缺血和缺氧有关。代谢组学-欧易生物-鹿明生物-专业技术团队-值得信赖。北京代谢组学平台建设
GC-MS非靶向代谢组学研究，中文标题：代谢组学分析和氧化应激反应揭示了有机磷类阻燃剂磷酸三(2-氯乙基)和磷酸三苯基对大肠杆菌的毒性研究对象：大肠杆菌发表期刊：Chemosphere影响因子：7.086作者单位：广东石油化工大学环境科学与工程学院涉及的欧易/鹿明生物服务产品：GC-MS非靶向代谢组学(由欧易/鹿明生物提供技术支持)以往有关呕吐***的研究多集中在免疫毒性、神经毒性、生殖毒性、遗传毒性等方面，而关于生长发育影响的研究较少。该研究是一篇通过大肠杆菌作为研究对象利用非靶向代谢组学来探究有机磷阻燃剂影响生物的发育和功能的高质量的、创新性的的研究文章，值得学习与借鉴。北京代谢组学 子痫前期代谢组学 寻找代谢物与生理病理的研究方式。
双平台代谢组学研究，2022年02月，中国中医科学院广安门医院李敏教授课题组在Biomedicine & Pharmacotherapy发表的题为 “Yiqi Tongluo Fang could preventive and delayed development and formation of diabetic retinopathy through antioxidant and anti-inflammatory effects ”的研究成果，发现了***通络方可有效地防治糖尿病并发症形成与发展，探究了***通络方防治糖尿病视网膜病变的作用机制，***通络方可改善糖尿病大鼠视网膜组织病理损害；提高视网膜紧密连接蛋白，保护血-视网膜屏障；抑制p38MAPK相关通路及IncRNA MALAT1水平；降低全身及局部视网膜的炎症及氧化应激水平。为***通络方防治糖尿病视网膜病变提供了实验依据。LC-MS+GC-MS双平台代谢组学主要用于***的中药成分分析。
高通量代谢组学研究,中文标题：高通量代谢组学方法发现***羊藿提取物对骨质疏松症影响的代谢生物标志物及途径发表期刊：Frontiersinpharmacology影响因子：5.810发表时间：2020年8月发表单位：南昌大学***附属医院运用组学技术：超高效液相色谱法结合四极杆飞行时间质谱法技术（UPLC-Q-TOF/MS）代谢组学。本研究采用UPLC-Q-TOF/MS代谢组学对OP模型中的大鼠和不同剂量Ext-epi处理的大鼠进行分析，从大鼠血清代谢组学和标志物相关代谢途径中揭示了46种潜在生物。不同剂量组的Ext-epi对16种潜在的生物标志物具有***的逆转作用，涉及三种主要的代谢途径，其中ZL-IL的***效果相对稳定，组间聚类比较明显，该剂量可被视为进一步研究的更好剂量。本研究从代谢组学水平评估了Ext-epi对OP的预防和***效果，为开发Ext-epi***OP提供了依据，也为开发OP***提取物提供了参考。非靶向代谢组学数据分析 靶向代谢组学数据分析。
LC-MS非靶向代谢技术发现了粪便移植（FMT）对血液代谢的影响。标题：藻酸盐寡糖化小鼠的微生物群成功减轻了小肠粘膜炎期刊：MicrobiomeIF=14.650研究思路：*样本类型：小鼠小肠、肠道内容物、血浆*检测平台：LC-MS非靶向代谢组、转录组、16S微生物多样性检测等本研究发现藻酸盐寡糖（AOS）可以减轻***药物白消安诱导的小肠细胞膜的损伤，特别是细胞连接和微绒毛；并有利于肠道菌群变化进而改善小肠功能，提高肠道的免疫功能。LC-MS非靶向代谢技术发现了粪便移植（FMT）对血液代谢的影响，并分析了血液代谢物与肠道菌群之间的相关性，发现不同剂量的粪便移植对血液代谢组均产生了***影响，其中大部分是在小肠功能中起着重要作用的脂质代谢物，表明FMT可以在血液中恢复被白消安扰乱的代谢物。相关性分析表明，“有益菌”乳酸杆菌有助于血液代谢产物的恢复，“有害菌群”则不能协助血液代谢物的回收，揭示了FMT可改善小肠功能和肠道菌群，恢复血液代谢的原因。代谢组学数据分析教程 代谢组学一般测几个样。江苏代谢组学贾伟
常用的代谢组学相关数据库有人类代谢组数据库KEGG数据库、Reactome数据库。北京代谢组学平台建设
有机酸靶向代谢组学研究：中文标题：通过代谢和转录组分析的综合分析鉴定控制东方甜瓜果实发育过程中可溶性糖和有机酸代谢的关键基因网络研究对象：甜瓜发表期刊：Front.PlantSci.影响因子：5.753发表时间：2022年5月12日合作单位:甘肃省农业科学院蔬菜研究所，中国农业大学园艺学院运用生物技术：非靶向代谢组学（由鹿明生物提供技术支持）、转录组学（由欧易生物提供技术支持）在本研究中，通过***的转录组分析和代谢物分析，作者发现东方甜瓜品种'甜宝'（A）的果实含糖量高，'小翠瓜'（B）的果实含糖量低，并同时在不同的发展阶段进行了比较。研究有助于阐明与甜瓜中糖和有机酸代谢相关的基因的动态和差异表达。北京代谢组学平台建设
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