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江西蛋白组学和基因组学的差异

来源: 发布时间:2022年11月29日

在本研究中,利用iTRAQ标记定量蛋白组学方法对东京野茉莉种子发育的4个时间点采样进行蛋白质组学分析。获得了2338个蛋白和1473个DEPs。Mfuzz聚类分析显示,在种子发育过程中,转录本和蛋白质组之间存在相当大的时序一致性。在四个发育时期中,花后70天(种子发育活跃期)是视为东京野茉莉种仁发育的关键时期:在该阶段与脂肪酸生物合成相关的功能基因和酶蛋白均达到表达峰值,同时种仁内部大部分营养物质开始迅速积累。通过转录组数据和蛋白质组数据综合分析油脂合成的调控网络,乙酰CoA羧化酶和**酸脱氢酶两个酶体系处于中心位置,在脂肪酸的合成过程中具有主导作用。蛋白质组学技术简介及应用场景。江西蛋白组学和基因组学的差异

TMT蛋白质组学探究案例:2021年9月,安徽农业大学张照亮教授课题组在Journal of Agricultural and Food Chemistry期刊发表了题为“Nitrogen-Regulated Theanine and Flavonoid Biosynthesis in Tea Plant Roots: Protein-Level Regulation Revealed by Multiomics Analyses”的研究成果,通过TMT蛋白质组学和泛素化蛋白质组学研究方法,发现了氮缺乏条件下茶树根部响应的差异表达蛋白和泛素化蛋白质,为茶氨酸和黄酮类生物合成的调控提供了新的见解,为茶树翻译后修饰调控次生代谢的研究提供了理论依据。江苏蛋白组学常用的研究技术上海 -蛋白质组学-提供高效检测分析服务。

本研究采用串联质量标签(TMT)标记的蛋白质组学和平行反应监测(PRM)技术,对莲子脱水过程中的生理调控网络进行了深入研究表明,碳水化合物代谢(包括糖酵解/糖异成、半乳糖代谢、淀粉和蔗糖代谢、磷酸戊糖途径和细胞壁组织)、ER中的蛋白质加工、DNA修复和抗氧化事件对莲种胎脱水有积极的反应。在莲种胚脱水过程中,非酶促抗氧化剂和戊糖磷酸和维生素E作为主要的抗氧化剂,在脱水过程中维持荷花胚胎的REDOX平衡。这些结果为揭示荷花胚胎脱水保护机制的生理学调控网络提供了酶途径在抗氧化保护中起着主要作用。应激生理学检测表明,H2O2是诱发氧化应激损伤的主要活性氧(ROS)成分,谷胱甘肽新的见解。

蛋白质组数据分析鉴定出了几种参与肝葡萄糖脂代谢的蛋白质(ACC、FASN、SCD1、CPT1A、GLUT2、GK、GS、G6Pase、PEPCK)。此外,AC显示出抑制脂肪生成酶(ACC,FASN和SCD1)表达的趋势,同时***上调了GLUT2。与对照组相比,AC***增加了PEPCK的表达,两种化学物质对G6Pase均无***影响(图4A)。PRM蛋白靶向验证测定结果与蛋白质组变化相一致,这进一步证实了蛋白质组学数据中蛋白质的表达(图4B)。转录组学和蛋白质组学联合分析结果显示AC和AL***改善了线粒体功能。GSEA分析显示,处理组的氧化磷酸化(OXPHOS)通路***上调,AC组和AL组的富集得分分别为0.826和0.535。蛋白组学检测一个样多少钱。

并通过蛋白质组学和时间序列分析在血管生成中发挥着关键作用(图3E)。时间序列分析表明,外出刺激后ICAM1表达增加(图3F)。此外,当ICAM1在HBMECs中时,血管形成容量***降低(图3I/j)。这些结果表明M-Exos通过增加HBMECs中的ICAM1的表达来调节血管生成。蛋白质组学分析发现的差异表达蛋白与多种神经退行性疾病相关,包括帕金森病、阿尔茨海默病和亨廷顿病(图6B)。本研究运用蛋白质组学,蛋白质印迹,免疫荧光、免疫组化等分析了源自MSCs的外泌体可以使人脑微血管内皮细胞(HBMECs)保持活跃状态,有利于血管生成。应用PD小鼠模型发现MSCs的外泌体可以促进PD的恢复。结果可以为MSCs衍生的外泌体在PD***方面提供可能性。蛋白组学研究组织,血液,植物,尿液,动物,细胞样品,酵母,微生物.。浙江itraq蛋白组学多少钱

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