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江苏代谢组学数据如何分析

来源: 发布时间:2022年11月07日

非靶向代谢组学研究:对于代谢物分析,作者对非靶代谢组学测定,共检测到4,346种代谢物。根据所有检测到的代谢物的投影中变量重要性(VIP)>1和p<0.05的筛选标准,在不同的比较组***研究了961种差异累积代谢物(DAM)(表1)。在A果实(AF)与B果实(BF)的相同成熟阶段,发现S3的DAM比S1和S2更丰富,这意味着DAM的主要变化发生在S3。随后,利用京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析进一步了解与两个东方甜瓜品种相关的生物学机制。其中,参与蔗糖和有机酸代谢的代谢物在果实中的积累差异更大,包括“半乳糖代谢”、“磷酸戊糖途径”、“果糖和甘露糖代谢”、“亚油酸代谢”和“花生四烯酸”。代谢组学热图聚类分析 火山图 散点图如何绘制。江苏代谢组学数据如何分析

GC-MS代谢组学结果:通过GC-MS代谢组学观察到 92种化合物,其中,49种与数据库中可用的化合物相匹配,包括重要的发酵代谢物,如葡萄糖、**酸、琥珀酸和几种 (n=10) 初级氨基酸。NMR也观察到了七种已鉴定的化合物。通过 GC-MS 测量,表面(15 厘米)SOM 中的糖和氨基酸浓度随温度处理而变化,随着温度的升高,通常趋向于更高的糖浓度和更低的游离氨基酸浓度(图 3)。谷氨酰胺在氨基酸中是一个明显的例外,在浓度与温度处理中观察到了积极的趋势(图 3)。此外,与植物应激反应相关的化合物(油酸、肌醇、半乳糖醇和 4-羟基-3-甲氧基苯甲酸)随温度升高而增加(SI 附录,图 S5)。江苏代谢组学 上海公司常用的代谢组学相关数据库有人类代谢组数据库KEGG数据库、Reactome数据库。

代谢组学研究:浓香白酒占中国白酒总产量的70%以上。自1960年代以来,在中国白酒酿造行业中,人工窖泥被***用于建造发酵窖以生产高质量的浓香白酒。为了深入了解人工窖泥原核生物分类和功能动力学机制,以及这种变化与生产高质量浓香白酒之间的联系,本文对该酿造微生态系统进行了***进行了16S rRNA测序,蛋白质组学和代谢组学联合分析。多组学方法能够更***地了解高质量浓香白酒生产过程中人工窖泥微生物群落发生的代谢过程变化,这将有助于进一步优化人工窖泥培养技术和改善浓香白酒的质量。

LC-MS非靶向代谢技术发现了粪便移植(FMT)对血液代谢的影响。标题:藻酸盐寡糖化小鼠的微生物群成功减轻了小肠粘膜炎期刊:MicrobiomeIF=14.650研究思路:*样本类型:小鼠小肠、肠道内容物、血浆*检测平台:LC-MS非靶向代谢组、转录组、16S微生物多样性检测等本研究发现藻酸盐寡糖(AOS)可以减轻***药物白消安诱导的小肠细胞膜的损伤,特别是细胞连接和微绒毛;并有利于肠道菌群变化进而改善小肠功能,提高肠道的免疫功能。LC-MS非靶向代谢技术发现了粪便移植(FMT)对血液代谢的影响,并分析了血液代谢物与肠道菌群之间的相关性,发现不同剂量的粪便移植对血液代谢组均产生了***影响,其中大部分是在小肠功能中起着重要作用的脂质代谢物,表明FMT可以在血液中恢复被白消安扰乱的代谢物。相关性分析表明,“有益菌”乳酸杆菌有助于血液代谢产物的恢复,“有害菌群”则不能协助血液代谢物的回收,揭示了FMT可改善小肠功能和肠道菌群,恢复血液代谢的原因。非靶向代谢组学 土壤非靶代谢学 非靶脂质组学研究。

非靶向GC-MS代谢组学、LC-MS代谢组学研究标题:中国浓香白酒生产过程中人工窖泥中原核生物群落的结构和功能变化研究对象:浓香白酒、人工窖泥期刊:mSystems影响因子:6.469发表时间:2020年3月合作单位:四川省农业科学院水稻高粱研究所运用欧易/鹿明生物技术:TMT标记定量蛋白质组学、PRM靶向验证、非靶向GC-MS代谢组学、LC-MS代谢组学、16SrRNA测序,本篇非靶向代谢组学分析共鉴定出7,478种代谢物。GC-MS代谢组学和LC-MS代谢组学方法在OP***A中均可明确分离批次(图5a至d)。在第四批人工窖泥样品中,分别上调和下调了491和523种代谢物。差异代谢产物被分为16个功能类别(图5f)。脂质和类脂质分子(38.07%)**多,其次是有机杂环化合物(16.17%)和有机酸及其衍生物(13.11%)。基于 LC-MS/GC-MS代谢组学 从样本采集到数据分析。江苏代谢组学产物

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双平台代谢组学研究,2022年02月,中国中医科学院广安门医院李敏教授课题组在Biomedicine & Pharmacotherapy发表的题为 “Yiqi Tongluo Fang could preventive and delayed development and formation of diabetic retinopathy through antioxidant and anti-inflammatory effects ”的研究成果,发现了***通络方可有效地防治糖尿病并发症形成与发展,探究了***通络方防治糖尿病视网膜病变的作用机制,***通络方可改善糖尿病大鼠视网膜组织病理损害;提高视网膜紧密连接蛋白,保护血-视网膜屏障;抑制p38MAPK相关通路及IncRNA MALAT1水平;降低全身及局部视网膜的炎症及氧化应激水平。为***通络方防治糖尿病视网膜病变提供了实验依据。LC-MS+GC-MS双平台代谢组学主要用于***的中药成分分析。江苏代谢组学数据如何分析

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