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浙江植物代谢组学技术

来源: 发布时间:2022年11月03日

GC-MS代谢组学结果:通过GC-MS代谢组学观察到 92种化合物,其中,49种与数据库中可用的化合物相匹配,包括重要的发酵代谢物,如葡萄糖、**酸、琥珀酸和几种 (n=10) 初级氨基酸。NMR也观察到了七种已鉴定的化合物。通过 GC-MS 测量,表面(15 厘米)SOM 中的糖和氨基酸浓度随温度处理而变化,随着温度的升高,通常趋向于更高的糖浓度和更低的游离氨基酸浓度(图 3)。谷氨酰胺在氨基酸中是一个明显的例外,在浓度与温度处理中观察到了积极的趋势(图 3)。此外,与植物应激反应相关的化合物(油酸、肌醇、半乳糖醇和 4-羟基-3-甲氧基苯甲酸)随温度升高而增加(SI 附录,图 S5)。读懂代谢组学 代谢组学的研究范畴。浙江植物代谢组学技术

非靶向代谢组学研究:通过在三个成熟阶段收获两个东方甜瓜品种的果实作者使用非靶代谢组学联合转录组学发现可溶性糖和有机酸在转录组水平和代谢组水平的差异现象。这项研究运用多组学技术联合揭示了两个品种成熟过程中关键的代谢和转录特征。在本研究中,通过代谢和转录组分析的综合分析,研究了控制两个东方甜瓜品种'甜宝'和'小翠瓜'中糖和有机酸代谢的基因网络。筛选了与糖和有机酸代谢相关的关键代谢物和候选基因,并讨论了甜瓜品种甜度不同的可能解释。研究结果提高了对决定甜瓜发育和成熟过程中糖和有机酸积累和代谢的分子机制的理解。江苏植物代谢组学技术代谢组学生物解析 非靶代谢组学研究 靶向代谢组学研究。

微生物16S rRNA测序+代谢组学研究:标题:EphB6缺陷小鼠的肠道菌群通过介导维生素B6动态平衡调节孤独症行为期刊:MicrobiomeIF=14.650研究思路:*样本类型:小鼠粪便、脑组织*检测平台:LC-MS非靶向代谢组、16S微生物多样性检测自闭症谱系障碍(ASD)是一种发育障碍,目前对孤独症的**症状的有效***很有限。ASD患者临床研究证据表明,肠道菌群与ASD发展之间存在联系,但肠道菌群与ASD的脑功能障碍(肠脑轴)联系机制尚未完全阐明。在肠道稳态起着重要作用的EphB6基因(位于7q号染色体,属于受体酪氨酸激酶Eph家族),因基因突变和在ASD患者中表达下调,被认为是ASD的候选基因。但尚不清楚EphB6在调节肠道菌群和ASD发生的作用机制。本研究中作者发现EphB6在功能上与ASD相关,并通过肠道菌群介导的维生素B6和多巴胺,调节患者自闭症样行为。作者建立了EphB6缺陷小鼠肠道菌群失调与内侧前额叶皮层(mPFC)(关键的肠脑功能轴)的兴奋/抑制失衡之间的功能联系。

作者研究发现**酸过量会导致葡萄酒颜色变浅,但**酸干扰对酵母细胞繁殖和β-葡萄糖苷酶活性均无***影响,随后通过非靶代谢组学、靶向代谢组学等技术研究**酸干扰过程中葡萄酒代谢物的变化,发现**酸过量会干扰酒精发酵过程中花青素的代谢,通过加速其异构化来削弱花青素浓度,从而影响葡萄酒色泽,因而在葡萄酒生产中过程中应避免**酸过量。通过非靶代谢组学技术,能够了解发酵过程中,发酵液代谢物的变化情况。了解到在糖酵解过程中,多余的PA会扰乱糖酵解和三羧酸循环的过程,从而深入了解葡萄酒发酵过程中颜色变化的原因。上海鹿明生物科技有限公司多年来,一直专注于生命科学和生命技术领域,是国内早期开展以蛋白组和代谢组为基础的多层组学整合实验与分析的团队。目前鹿明生物在顶空代谢组学研究已经有了成熟的技术方法和多项项目经验。代谢组学-方法与应用-实验操作-仪器设备。

非靶代谢组学研究:2022年03月,欧易/鹿明生物合作客户重庆医科大学附属第二医院消化内科周智航团队在International Journal of Biological Sciences期刊发表的题为 “Enhanced pentose phosphate pathway activity promotes pancreatic ductal adenocarcinoma progression via activating YAP/MMP1 axis under chronic acidosis”的研究成果,通过采用非靶代谢组学和基因表达芯片,发现了适应酸性微环境的胰腺导管腺* (PDAC)细胞具有更强的转移和增殖能力。


代谢组学显示适应酸性微环境的 PDAC 细胞中葡萄糖增加、糖酵解减少,而转录组学发现适应酸性微环境细胞中的差异表达基因主要为细胞外基质修饰和 Hippo 信号传导相关基因。MMP1 在在适应酸性微环境细胞中上调**为明显,实验验证了其由 YAP/TAZ 通路介导,而被 AMPK抑制。该研究确认了代谢重编程通过AMPK/ YAP /MMP1轴促进适应酸性微环境的 PDAC 细胞的增殖和转移。 代谢组学分析 代谢组学检测 代谢组学价格 代谢组学数据分析流程 。浙江能量代谢组学

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微生物组和代谢组学结果表明,高比例的直链淀粉/支链淀粉比例能够调节消化和粘膜相关的盲肠微生物群落和代谢特征。三种比例中,喂养含有50%高直链淀粉的饮食具有更好的结果,因为其共生细菌(如Akkermansia,Lactobacillus和Faecalibacterium)的富集,戊酸盐的增加以及促炎细胞因子的减少。代谢组学结果显示盲肠组织的代谢特征发生了改变,包括脂质肉碱和α-生育酚等代谢物的上调和下调。这些发现为直链淀粉/支链淀粉的比例是如何通过调节微生物发酵,导致共生微生物群和代谢物的增殖,从而改善断奶山羊的盲肠环境提供了新的见解。本篇文章,检测了喂食不同直链淀粉/支链淀粉比例的山羊的盲肠中SCFAs和炎症因子的变化,并使用16s RNA测序检测了不同组山羊的盲肠粘膜和消化物中微生物的变化,找到了变化的优势菌群以及菌群和SCFAs的相关性。再使用LC-MS/MS非靶代谢组学研究了不同组山羊盲肠组织的代谢物变化。通过多组学结合的方式,揭示了不同比例的直链淀粉/支链淀粉对山羊盲肠环境的影响。浙江植物代谢组学技术

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