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广东蛋白组学数据上传

来源: 发布时间:2022年10月28日

2021年10月,中国科学院上海营养与健康研究所武爱波研究员课题组在《Ecotoxicology and Environmental Safety》(IF:6.291)发表了题为“Mycotoxin deoxynivalenol affects myoblast differentiation via downregulating cytoskeleton and ECM-integrin-FAK-RAC-PAK signaling pathway"的研究成果,通过转录组学和蛋白质组学研究方法,探究了脱氧雪腐镰刀菌烯醇(简称:DON,俗称呕吐***)对成肌细胞分化的影响,发现了DON处理使得细胞骨架蛋白和细胞外基质蛋白表达下调,并抑制ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信号通路的机理,为食品和饲料污染的防治提供了理论依据。其中转录组学和蛋白组学由欧易/鹿明生物提供技术支持。蛋白组学近期研究进展的盘点。广东蛋白组学数据上传

蛋白组学技术是以蛋白质组为研究对象,研究细胞、组织或生物体蛋白质组成及其变化规律的科学。DIA作为一种新的质谱数据采集方式稳定性高,覆盖度广的优点。DIA蛋白组学技术已经越来越多的疾病研究中发挥重大作用。本研究通过DIA蛋白组学技术分析了8个SAPHO病人和8个健康人的蛋白表达谱。蛋白表达的相关性图显示组内相关性良好,差异蛋白的PCA图显示两组得到明显的区分。蛋白质组学通过研究生物样本中蛋白质组成和变化,从而推动疾病的病理机制研究,为临床诊断和预后提供潜在生物标志物。江西蛋白组学研究扎根蛋白组学临床科研基础研究领域,多年项目服务经验。

iTRAQ标记定量蛋白组学研究方法:2021年4月,南京林业大学喻方圆教授(一作:吴岐奎)课题组在JournaloftheScienceofFoodandAgriculture期刊发表了题为“ProteomicanalysisofmetabolicmechanismsassociatedwithfattyacidbiosynthesisduringStyraxtonkinensiskerneldevelopment”的研究成果,通过转录组学+iTRAQ标记定量蛋白组学研究方法,分析东京野茉莉种子发育过程中脂肪酸生物合成相关基因的表达趋势,确定油脂积累的主要影响因子并构建其调控网络。为野茉莉属植物种子油用研究和后续功能分析研究提供了一定的研究基础。

文章使用TMT标记定量蛋白质组学的方法,分析鉴定了差异表达的蛋白质,对下调的蛋白质进行基因本体论(GO)分析,显示下调参与线粒体电子传递链(ETC)的途径富集,证明了TM处理特别影响了具有较高细胞内铜水平的SOX2/OCT4+细胞中的线粒体ETC途径。确定TM介导的铜依赖性线粒体复合物IV失活是SOX2/OCT4+群体中的主要代谢缺陷。研究结果确定了铜-代谢-转移轴,并强调了其作为高危TNBC患者的下一代治疗方法的潜力。蛋白质组学分析确定了富含线粒体功能的途径。细胞色素c氧化酶 (Complex IV) 是一种线粒体金属酶,是线粒体ETC的终末酶。修饰蛋白质组试-蛋白质组学 解决方案。

TMT标记定量蛋白组学研究案例:2021年11月,南京中医药大学附属医院江苏省中医院单位(一作刘史佳研究员)及其课题组在MolecularMetabolism期刊发表的题为“Serumintegrativeomicsrevealsthelandscapeofhumandiabetickidneydisease”的研究成果,通过TMT标记定量蛋白组学和GC-MS非靶代谢组学研究方法,发现了糖尿病肾病(DKD)特征,筛选了蛋白和代谢组合生物标志物。为优化糖尿病肾病(DKD)管理提供了丰富且开放访问的数据资源。中文标题:血清综合组学揭示人类糖尿病肾病情况研究对象:人血清发表期刊:MolecularMetabolism影响因子:7.422发表时间:2021年11月1日合作单位:江苏省中医院运用生物技术:TMT标记定量蛋白质组学、GC-MS非靶向代谢组学(其中部分工作由欧易/鹿明生物提供技术支持)、ELISA蛋白质组学ppt 蛋白组学测序一个多少钱。内蒙古口腔蛋白组学

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为了验证TMT蛋白组学数据,作者选择了18个与莲种胚脱水保护功能密切相关的候选DEPs进行PRM蛋白靶向验证。PRM鉴定了18个候选DEPs。这些蛋白质的表达模式在PRM和TMT的定量结果之间显示出类似的趋势。然而,PRM检测到的蛋白丰度的倍数变化值要大于TMT数据。这一结果在很大程度上支持了TMT数据的可靠性。基于TMT标记定量蛋白质组学的生物信息学分析,对胁迫生理指标进行了测定,以验证莲种胚脱水的保护机制。在快速脱水阶段,REC和MDA含量的变化与RWC相反,它们的水平迅速增加(图6A,B)。ABA含量在快速脱水和脱水成熟阶段前略有增加(图6C)。上广东蛋白组学数据上传

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