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内蒙古医学蛋白组学

来源: 发布时间:2022年09月20日

随着美国临床蛋白质组**分析项目(CPTAC)和中国人类蛋白质组计划(CNHPP)等大型蛋白质组学研究计划的推进,发表了一系列**的大规模人群多组学分析文章[2,3]。这些高分文章通过基因组学、转录组学、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、代谢组学、微生物组学等技术,在上百例的病例样本中***表征了某种**的分子特征。对比这些文章,可以发现蛋白质组学数据在多组学数据分析中逐渐成为**结果,且蛋白质组学数据分析有些共同特点,即:1)基于蛋白质组进行**分子分型2)分析不同亚型患者的临床特征3)免疫、代谢、突变、微生物等**领域研究热点在不同亚型中的差别分析4)筛选亚型特征分子作为预后标志物或潜在的药靶进行验证或机制研究该文是樊嘉院士/周虎研究员/高大明研究员/**教授团队继2019年Cell发表的肝细胞*多组学研究后,同样基于蛋白质组为**的多组学联合分析策略,进一步阐释了蛋白质组学驱动精细医学的优势,为**的发***展机制、分子分型、预后监测和个性化***策略提供新思路。一站式服务,蛋白组学研究不同生物体在不同时刻/状态下蛋白质表达的变化。内蒙古医学蛋白组学

作者通过iTRAQ蛋白质组学技术鉴定敲低NMT1后发生变化的蛋白质。结果鉴定到三种上调蛋白(LXN,RPL29andFAU)和六种下调蛋白(NMT1,MTPN,AHSG,ALB,GON7andTF)(图2A)。作者将这些蛋白质分别命名为N-豆蔻酰化下调蛋白(NDP)和上调蛋白(NUP)。有趣的是,敲低NMT1会减少NDP和NUP的N-豆蔻酰化,而过表达NMT1会诱导NDP和NUP的N-豆蔻酰化(图2B)。在小鼠模型中,敲除NMT1会导致NDP和NUP的去N-豆蔻酰化,这可以通过在肝脏中表达外源性NMT1来部分逆转(图2C)。这些发现表明,尽管NMT1对NDP和NUP的表达起着相反的作用,但NMT1同时刺激NDP和NUP的N-豆蔻酰化。辽宁蛋白组学的结果蛋白组学检测一个样多少钱。

蛋白质是生命功能的直接体现者,近几年来,蛋白质组研究越来越多的体现在多种疾病机理的阐明,为科研问题攻克提供理论根据和解决途径。通过蛋白质组比较分析,找到特异性的蛋白,成为新药物设计的分子靶点,为疾病的早期诊断提供分子标志。然而生物体内的蛋白组学是一个非常复杂的体系。近几年来,由于质谱技术的发展,让我们对生物体内蛋白组的认识更加***和准确。尤其基于TimsTOF Pro系列质谱仪,被称为4D蛋白组学技术为蛋白组学提供全新的覆盖深度和通量,为精细医疗提供**技术支持力量。欧易生物、鹿明生物助力您的4D蛋白组学研究。

本文为了探究其潜在的分子机制,作者运用RNA测序(RNA-seq)和iTRAQ标记定量蛋白组学,对不同成熟度水平的油脂种子进行了研究。不仅揭示了关键候选基因和蛋白质的时间特异性表达,而且为该树种的遗传改良提供了科学依据。中文标题:基于iTRAQ蛋白质组学和转录组学联合分析揭示油茶种子成熟过程中油质相关的关键代谢产物的积累研究对象:油茶种子发表期刊:HorticultureResearch影响因子:6.793发表时间:2021.07.01发表单位:海南大学园艺园林学院运用生物技术:RNA测序(RNA-seq)和iTRAQ标记定量蛋白组学、转录组学、蛋白组学文章中iTRAQ标记定量蛋白组学由欧易/鹿明生物提供技术支持一文了解DIA、TMT/iTRAQ、传统Label free蛋白组学区别在哪。

为了更好地了解DON对C2C12细胞分化的影响,作者进行了转录组学和蛋白质组学的整合分析。共鉴定了149个共同的***差异基因(co-DEG),其中91%被共下调(图3A)。15%的co-DEG属于真核细胞骨架,其中大部分属于肌动蛋白丝,少数是中间丝和微管的成分。对co-DEG进行GO分析,生物学过程富集了“骨骼肌肌球蛋白粗丝组装”和“快肌纤维收缩的正向调节”条目。细胞组分中富集的**个条目是“纤维蛋白原复合物”、“细胞外空间”、“细胞外基质”、“细胞外区域”和“蛋白质细胞外基质”,这些都是细胞外成分(图3B)。结果表明,DON主要影响肌肉成分的组成和功能以及多种细胞外成分的表达。通路富集分析富集到了“ECM-受体相互作用”、“蛋白质消化和吸收”、“人**瘤病毒***”和“粘着斑”等通路。修饰蛋白质组试剂及服务,蛋白质组学解决方案。辽宁蛋白组学研究路线及研究技术

单细胞蛋白质组学,极微量样本检测。内蒙古医学蛋白组学

并通过蛋白质组学和时间序列分析在血管生成中发挥着关键作用(图3E)。时间序列分析表明,外出刺激后ICAM1表达增加(图3F)。此外,当ICAM1在HBMECs中时,血管形成容量***降低(图3I/j)。这些结果表明M-Exos通过增加HBMECs中的ICAM1的表达来调节血管生成。蛋白质组学分析发现的差异表达蛋白与多种神经退行性疾病相关,包括帕金森病、阿尔茨海默病和亨廷顿病(图6B)。本研究运用蛋白质组学,蛋白质印迹,免疫荧光、免疫组化等分析了源自MSCs的外泌体可以使人脑微血管内皮细胞(HBMECs)保持活跃状态,有利于血管生成。应用PD小鼠模型发现MSCs的外泌体可以促进PD的恢复。结果可以为MSCs衍生的外泌体在PD***方面提供可能性。内蒙古医学蛋白组学

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