转录本的空间位置信息可以通过在原位阵列上捕获的组织切片中的转录本来获取，目前已有多种技术策略被开发报道， 如空间转录组技术（Spatial Transcriptomics，ST）和 Visium 技术，通过将包含空间位置信息的条形码、UMI 标签、poly-dT 的探针固定在商用微阵列载玻片上，来捕获包含 poly(A) 尾巴的转录本，并获取全转录组水平的基因表达及位置信息。一些无需成像即可计算重建空间基因表达模式所需信息的技术也被开发了出来，其中之一就是是 DNA 显微技术，它记录 cDNA 之间的接近度，该信息可用于重建转录本之间的相对位置。除大脑以外的其他***的技术现代化，将为开发有用的空间转录组学地图集提供广阔的前景。山西欧易生物空间转录组做什么
Visium空间转录组能够做何种组织类型以及推荐切片厚度是什么？10X Genomics测试过很多组织类型，绝大多数都可以用于空间转录组的分析。下图是他们官网上测试过的组织类型的列表，测试过的组织都可以运用在空间转录组的分析上面。但建议用户用基因表达玻片做正式实验前，务必用组织优化的玻片测试一下，看组织能否用于空间转录组的实验，同时也找到比较好的组织通透时间。切片厚度基本上以10µm为主，但也有少量组织例外。欧易生物具有上百例空间转录组项目执行经验，致力通过质量的服务，助力各位科研工作者取得新的突破。辽宁生物技术空间转录组过真实研究案例聚焦包括单细胞转录组、单细胞基因组、单细胞代谢组、空间转录组。
空间转录组是在组织原位检测基因表达的一种技术，与bulk RNA-seq或单细胞转录组测序相比，空间转录组避免了组织中细胞位置信息的丢失，使得我们在检测基因表达的同时获得基因在组织内部的空间位置信息。已发表的关于空间转录组技术有Slide-seq , LCM-seq , seqFISH, MERFISH , Liver single cell zonation , Geo-seq and Tomo-seq。这些方法或是在细胞数量上限制较大，或是存在有效测序深度不足等问题。正是由于空间转录组可以从多维度解析生物学过程的特点，近年来关于空间转录组无论是在技术开发，还是大规模应用或商业化，都得到蓬勃发展。
本文利用空间转录组学研究了在AD小鼠模型中，淀粉样斑块周围直径为100mm的组织域中发生的转录变化。发现了富含髓鞘和少突胶质细胞基因（OLIGs）的基因共表达网络的早期改变，而斑块诱导的基因（PIGs）的多细胞基因共表达网络涉及补体系统、氧化应激、溶酶体和炎症，在疾病的后期非常突出。此外作者通过对小鼠和人脑切片进行原位测序（ISS），证实了大多数观察到的细胞水平的变化。空间转录组学分析为探究AD和其他脑部疾病致病特征附近失调的细胞网络提供了可能。如何通过“HE染色”判断空间转录组项目样本是否为“好的样本”呢？
空间转录组技术作为当今前沿的科研技术，相信很多老师都希望将其运用于自己的课题中，快速发表高分文章。欧易生物具有上百例空间转录组项目执行经验，致力通过质量的服务，助力各位科研工作者取得新的突破。由上海欧易生物医学科技有限公司（以下简称“欧易生物”）主办的“空间转录组学培训班”落下帷幕。培训中，欧易讲师团队以其丰富的项目经验及专业的生信能力，从空间转录组学的发展历程、测序原理、实验实操及数据挖掘等多维度，向远道而来的学员们展开了系统性的培训。
许多当前时代空间转录组技术的基础都是在自七十年代以来的几十年间建立的。北京空间转录组是什么
研究的***主要集中于人类和小鼠的大脑，而其他***（例如肝脏）的空间转录组学研究相对滞后。山西欧易生物空间转录组做什么
BayesSpace是一种基于空间转录组模型的聚类方法，通过对基因表达矩阵的低维表示进行建模并通过空间先验鼓励相邻点属于同一簇来实现空间聚类。与以前的方法相比，BayesSpace允许对聚类结构和错误项进行更灵活的规范。BayeSpace通过***使用的Bioconductor SingleCellExperiment数据结构将预处理数据作为输入，无缝集成到空间转录组分析工作流中，输出同样存储在SingleCellExperiment对象中，该对象可用于下游分析。BayesSpace增强的空间聚类提供了一个更高分辨率的组织类型图。值得注意的是，增强后的空间聚类识别了沿**边界的淋巴组织区域和可能的免疫浸润到**中的区域，这些区域在原来的分辨率下是无法辨别的。山西欧易生物空间转录组做什么
上海欧易生物医学科技有限公司总部位于联航路1188号25幢，是一家检验检测服务。（依法须经批准的项目，经相关部门批准后方可开展经营活动，具体经营项目以相关部门批准文件或许可证件为准）一般项目：生物医药产品、生化产品的研发，医药中间体、化工原料及产品（除危险品化学品、监控化学品、易制毒化学品）的研发、销售，仪器仪表的销售，并提供相关技术咨询、技术服务，会务服务，企业管理咨询。的公司。公司自创立以来，投身于科研服务，科研检测，学术研究，技术咨询，是医药健康的主力军。欧易生物继续坚定不移地走高质量发展道路，既要实现基本面稳定增长，又要聚焦关键领域，实现转型再突破。欧易生物始终关注医药健康市场，以敏锐的市场洞察力，实现与客户的成长共赢。