作者运用iTRAQ标记定量蛋白组学对种子发育过程中蛋白质表达的定量比较，同时进行GO和KEGG通路富集分析。结果表明所有鉴定的蛋白被分为29类，主要涉及翻译和碳水化合物代谢。并且作者绘制了p值小于0.01的前20条KEGG通路的气泡图。在三对比较中，普遍富集的途径包括脂肪酸降解、苯丙素生物合成和脂肪酸代谢。其中，参与α-亚麻酸代谢的DAPs在S3 vs. S1组和S4 vs. S1组中都非常活跃。为了评估转录组和蛋白质组之间的一致性，以及了解转录后的mRNA在蛋白质水平上是如何表现的，作者进行了RNA-seq和iTRAQ分析的联合分析。证明DEGs和DAPs参与类黄酮的生物合成和脂肪酸代谢。蛋白组学近期研究进展的盘点。浙江蛋白组学kegg分析
iTRAQ蛋白质组学研究实用案例：2021年8月，浙江大学药学院何俏军、罗沛华团队在Autophagy期刊发表了题为“Autophagic degradation of CCN2 (cellular communication network factor 2) causes cardiotoxicity of sunitinib”的研究成果，通过动物模型、功能实验、iTRAQ蛋白质组学等研究方法，发现了舒尼替尼诱导的自噬导致心肌细胞凋亡和心脏功能障碍，探究了舒尼替尼诱导的适应不良自噬通过TOLLIP介导的内体相关通路选择性降解心肌细胞存活介质CCN2的机理，揭示了调节心肌细胞死亡的自噬降解新靶标蛋白。为提高基于舒尼替尼的*****安全性提供了方法及理论依据。中文标题：CCN2的自噬降解导致舒尼替尼的心脏毒性研究对象：小鼠发表期刊：Autophagy影响因子：16.016发表时间：2021年8月合作单位：浙江大学药学院运用生物技术：iTRAQ蛋白质组学(由鹿明生物提供技术支持)上海dia 蛋白组学单细胞蛋白质组学，极微量样本检测。
并通过蛋白质组学和时间序列分析在血管生成中发挥着关键作用（图3E）。时间序列分析表明，外出刺激后ICAM1表达增加（图3F）。此外，当ICAM1在HBMECs中时，血管形成容量***降低（图3I/j）。这些结果表明M-Exos通过增加HBMECs中的ICAM1的表达来调节血管生成。蛋白质组学分析发现的差异表达蛋白与多种神经退行性疾病相关，包括帕金森病、阿尔茨海默病和亨廷顿病(图6B)。本研究运用蛋白质组学，蛋白质印迹，免疫荧光、免疫组化等分析了源自MSCs的外泌体可以使人脑微血管内皮细胞(HBMECs)保持活跃状态，有利于血管生成。应用PD小鼠模型发现MSCs的外泌体可以促进PD的恢复。结果可以为MSCs衍生的外泌体在PD***方面提供可能性。
iTRAQ标记定量蛋白组学技术鉴定AHSG和RPL29分别是上调和下调*****的蛋白。301份肝*标本的统计分析表明AHSG与NMT1呈正相关，而RPL29与NMT1呈负相关（图8A）。此外，NMT1和AHSG均与**分期正相关，而RPL29与肝*的**分期呈负相关（图8B）。值得注意的是，NMT1和AHSG水平较高的肝*患者的生存率低于水平较低的肝*患者（图8C）。而较高水平的RPL29表明存活率较高（图8C）。这些数据表明NMT1、NUP和NDP与肝*的临床结果密切相关。iTRAQ蛋白质组学技术鉴定NMT1敲除时发生变化的蛋白质；蛋白组学常见研究模式,蛋白样本准备注意事项以及经典案例解读。
蛋白质组学技术研究案例：作为一种常见的******，脱氧雪腐镰刀菌烯醇(DON)在田间或加工和储存过程中会污染谷物和饲料。DON在动物中会引起厌食和生长迟缓在内的一系列不良反应。本文作者使用转录组学和蛋白质组学技术对鼠C2C12细胞进行了研究，分析DON对成肌细胞分化的影响。研究结果表明，DON通过下调细胞骨架和ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信号通路来影响成肌细胞的分化。本文研究体现了组学技术在机制研究中的重要作用。中文标题：霉菌***脱氧雪腐镰刀菌烯醇通过下调细胞骨架和ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信号通路影响成肌细胞分化研究对象：脱氧雪腐镰刀菌烯醇、C2C12细胞发表期刊：EcotoxicologyandEnvironmentalSafety影响因子：6.291发表时间：2021年10月发表单位：中国科学院上海营养与健康研究所运用生物技术：转录组学和蛋白质组学(由欧易/鹿明生物提供技术支持)、免疫荧光、免疫印迹、PCRTMT/iTRAQ标记定量蛋白组学 差异表达蛋白质组分析研究。江苏蛋白组学四代
定量蛋白质组学 蛋白质进行质谱检测未知蛋白进行全检测。浙江蛋白组学kegg分析
蛋白组学技术是以蛋白质组为研究对象，研究细胞、组织或生物体蛋白质组成及其变化规律的科学。DIA作为一种新的质谱数据采集方式稳定性高，覆盖度广的优点。DIA蛋白组学技术已经越来越多的疾病研究中发挥重大作用。本研究通过DIA蛋白组学技术分析了8个SAPHO病人和8个健康人的蛋白表达谱。蛋白表达的相关性图显示组内相关性良好，差异蛋白的PCA图显示两组得到明显的区分。蛋白质组学通过研究生物样本中蛋白质组成和变化，从而推动疾病的病理机制研究，为临床诊断和预后提供潜在生物标志物。浙江蛋白组学kegg分析
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