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山东蛋白组学meta分析

来源: 发布时间:2022年05月26日

本研究通过生理和蛋白质组学分析在冬油菜中鉴定了大量的冷胁迫响应蛋白。探讨了冬油菜耐冻性增强的机理和低温胁迫对冬油菜形态和生理生化变化的影响。文章以耐冻型Longyou 7和冷敏感型Lenox为材料,通过iTRAQ标记蛋白组学和转录组学分析,揭示了谷胱甘肽转移酶活性、碳水化合物结合和谷胱甘肽结合、代谢过程及IAA反应与冷应激反应密切相关,鉴定出了Longyou 7和Lenox之间的DAPs,这些DAPs参与氨基酸、碳水化合物、脂质和能量代谢,对提高冬油菜的耐冻性发挥了重要作用。label free蛋白组学蛋白质组学原理。山东蛋白组学meta分析

转录组学和蛋白质组学分析作者通过转录组学和蛋白质组学分析暴露于DON的C2C12细胞的差异基因(DEG)。转录组学鉴定了2387个DEG,其中72%被下调。蛋白质组学鉴定出402个DEG,其中74%被下调。GO和KEGG通路富集分析表明,转录组学DEGs参与了“男性主要性征的发育”、“骨骼肌肌球蛋白粗丝组装”和“骨骼肌收缩的调节”等生物学过程。**富集的通路是“ECM-受体相互作用”、“人**瘤病毒***”和“蛋白质消化吸收”。蛋白质组学分析中,富集到了“肌肉收缩”、“中间丝解聚”和“脂质转运”等生物学过程。细胞成分中富集到“细胞骨架”、“细胞外基质”和“整合素”。KEGG通路富集到“新霉素、卡那霉素和庆大霉素生物合成”、“系统性红斑狼疮”、“ECM-受体相互作用”和“蛋白质消化和吸收”。前两条通路与上调的DEG相关,而后两条通路与下调的DEG相关,这与转录组学结果一致。山东蛋白组学课程蛋白质组学生物标志物&机制研究一站式服务。

作者运用iTRAQ标记定量蛋白组学对种子发育过程中蛋白质表达的定量比较,同时进行GO和KEGG通路富集分析。结果表明所有鉴定的蛋白被分为29类,主要涉及翻译和碳水化合物代谢。并且作者绘制了p值小于0.01的前20条KEGG通路的气泡图。在三对比较中,普遍富集的途径包括脂肪酸降解、苯丙素生物合成和脂肪酸代谢。其中,参与α-亚麻酸代谢的DAPs在S3 vs. S1组和S4 vs. S1组中都非常活跃。为了评估转录组和蛋白质组之间的一致性,以及了解转录后的mRNA在蛋白质水平上是如何表现的,作者进行了RNA-seq和iTRAQ分析的联合分析。证明DEGs和DAPs参与类黄酮的生物合成和脂肪酸代谢。

3篇经典的蛋白组学和代谢组学在水产动物中的研究。水产动物的研究不仅是保障我国海水养殖业的健康可持续发展,同时可为良种创制、海洋环境研究、生态研究等提供重要理论基础和技术支撑~因此在水产生物研究方面蛋白组学、代谢组学在其中起到什么作用呢?期望这3篇经典文章能给您思路~中文标题:CO2诱导的海洋酸化损害了太平洋牡蛎对金氏弧菌的免疫功能:细胞和蛋白质组学的综合研究研究对象:牡蛎发表期刊:ScienceoftheTotalEnvironment影响因子:6.551合作单位:中国科学院海岸带研究所运用欧易/鹿明生物技术:iTRAQ标记定量蛋白质组学(由鹿明生物提供技术支持)蛋白组学常见研究模式,蛋白样本准备注意事项以及经典案例解读。

本文为了探究其潜在的分子机制,作者运用RNA测序(RNA-seq)和iTRAQ标记定量蛋白组学,对不同成熟度水平的油脂种子进行了研究。不仅揭示了关键候选基因和蛋白质的时间特异性表达,而且为该树种的遗传改良提供了科学依据。中文标题:基于iTRAQ蛋白质组学和转录组学联合分析揭示油茶种子成熟过程中油质相关的关键代谢产物的积累研究对象:油茶种子发表期刊:HorticultureResearch影响因子:6.793发表时间:2021.07.01发表单位:海南大学园艺园林学院运用生物技术:RNA测序(RNA-seq)和iTRAQ标记定量蛋白组学、转录组学、蛋白组学文章中iTRAQ标记定量蛋白组学由欧易/鹿明生物提供技术支持欧易鹿明生物蛋白质研究技术。吉林蛋白组学数据库

一站式服务,研究不同生物体在不同时刻/状态下蛋白质表达的变化。山东蛋白组学meta分析

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