10x Genomics空间转录组技术的准确性高吗？下图是一个将10x Genomics空间转录组技术应用于小鼠海马体研究的案例。A图为脑组织切片的HE染色结果，从10x Genomics空间转录组分析结果中，可以清晰看到Tmsb4x（B图）和Selenow（C图）在海马体区域高表达，和已知的研究结果一致性较高。开展10x Genomics空间转录组需要做哪些准备？空间转录组是一项十分前沿的技术，涉及到很多细节方面的准备工作，例如组织类型的选择、前期预实验的设计、病理区域的确认等一系列内容。而且实验中存在很多不确定性因素，处理不慎容易导致整个项目失败。空间转录组样本的组织切片的细胞中会释放出mRNA，迁移到每个spot的mRNA会被标记上相应的barcode序列。陕西空间转录组领域
Visium空间转录组能够做何种组织类型以及推荐切片厚度是什么？10X Genomics测试过很多组织类型，绝大多数都可以用于空间转录组的分析。下图是他们官网上测试过的组织类型的列表，测试过的组织都可以运用在空间转录组的分析上面。但建议用户用基因表达玻片做正式实验前，务必用组织优化的玻片测试一下，看组织能否用于空间转录组的实验，同时也找到比较好的组织通透时间。切片厚度基本上以10µm为主，但也有少量组织例外。欧易生物具有上百例空间转录组项目执行经验，致力通过质量的服务，助力各位科研工作者取得新的突破。黑龙江空间转录组使用研究通过对 ALS 小鼠疾病进程（症状前、发病、症状期和终末期）的脊髓组织进行空间转录组测序。
空间转录组的应用有哪些？一、构建空间转录组图谱：借助于空间分辨的单细胞转录组学，建立图谱可能是在分子水平上研究生物体结构的重要步骤。目前的多项研究通过单细胞转录组技术结合空间转录技术，得到多个***的时空转录组图谱（相关研究后续会在如下专辑更新）。二、描绘胚胎发育和空间蓝图：胚胎发育是一个复杂的过程，其中动态变化在生物分子水平上迅速发生。对这种微观变化的时间和空间方面的分析都具有挑战性。预期使用空间转录组学技术可以表征胚胎发育的空间表达蓝图。
10xVisium空间转录组技术原理为将新鲜冷冻的组织切片，置于文库制备载玻片上，经过固定、染色和透化后，释放出mRNA，mRNA与空间条形码捕获探针相结合，从而捕获基因表达信息。然后将捕获的mRNA合成cDNA并制备测序文库进行测序，并对数据进行可视化分析。空间转录组技术作为当今**前沿的科研技术，相信很多老师都希望将其运用于自己的课题中，快速发表高分文章。欧易生物具有上百例空间转录组项目执行经验，致力通过质量的服务，助力各位科研工作者取得新的突破。结合空间转录组测序技术，作者进一步确定和丰富了胚胎心脏基因表达的空间注释信息。
本文利用空间转录组学研究了在AD小鼠模型中，淀粉样斑块周围直径为100mm的组织域中发生的转录变化。发现了富含髓鞘和少突胶质细胞基因（OLIGs）的基因共表达网络的早期改变，而斑块诱导的基因（PIGs）的多细胞基因共表达网络涉及补体系统、氧化应激、溶酶体和炎症，在疾病的后期非常突出。此外作者通过对小鼠和人脑切片进行原位测序（ISS），证实了大多数观察到的细胞水平的变化。空间转录组学分析为探究AD和其他脑部疾病致病特征附近失调的细胞网络提供了可能。空间转录组的组学板块包括cDNA的合成、扩增、接头连接和测序，记录切片的转录本信息和空间位置信息 。天津欧易生物空间转录组做什么
空间转录组学和 10X Visium 依靠这种微阵列技术，区别在于微阵列载玻片上的组织上的转录本信息。陕西空间转录组领域
空间转录组（Spatial Transcriptomics）就是将基因的表达情况与关注的组织切片的免疫化学染色图像进行整合，从而将组织内不同细胞的基因表达信息定位到组织的原始空间位置上去，进而直接观测组织中不同部位功能区基因表达的差异。空间转录组技术利用了常规的原位技术和组学技术两方面的优势。目前已发表的关于空间转录组技术有主要有 Spatial Transcriptomics, Slide-seq, LCM-seq, seqFISH, MERFISH, Liver single cell zonation, Geo-seq 和 Tomo-seq, 涉及物种有人、小鼠、果蝇、秀丽隐杆线虫、斑马鱼、拟南芥、杨树和云杉等。陕西空间转录组领域
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