空间转录组是在组织原位检测基因表达的一种技术，与bulk RNA-seq或单细胞转录组测序相比，空间转录组避免了组织中细胞位置信息的丢失，使得我们在检测基因表达的同时获得基因在组织内部的空间位置信息。已发表的关于空间转录组技术有Slide-seq , LCM-seq , seqFISH, MERFISH , Liver single cell zonation , Geo-seq and Tomo-seq。这些方法或是在细胞数量上限制较大，或是存在有效测序深度不足等问题。正是由于空间转录组可以从多维度解析生物学过程的特点，近年来关于空间转录组无论是在技术开发，还是大规模应用或商业化，都得到蓬勃发展。
结合空间转录组测序技术，作者进一步确定和丰富了胚胎心脏基因表达的空间注释信息。上海欧易生物空间转录组应用
第二，数据库的建立。尽管当前空间转录组的数据在快速地增长，但尚未有对应的数据库来对这些数据进行汇总集成。第三，研究物种及组织的多样化。在当前时代，除 LCM 之外，研究的***主要集中于人类和小鼠的大脑，而其他***（例如肝脏）的空间转录组学研究相对滞后。对除人类和小鼠以外的其他生物以及除大脑以外的其他***的技术现代化，将为开发有用的空间转录组学地图集提供广阔的前景。第四，集成度高、交互性强、易扩展、文档信息完善的开源工作流程的开发。该类工具的开发将简化不同类型空间转录组学数据的整合和分析。福建空间转录组是什么本次培训班旨在跟广大科研工作者介绍空间转录组的研究热点和方案设计。
10x Genomics空间转录组用于文库构建的每张载玻片上有四个捕获区域，每个捕获区域的大小为6.5x6.5mm，包含5000个被条形码标记的点（barcoded spots），每个点的直径为55 μm，点和点之间中心的距离为100 μm，并且每个点都有一个barcode序列。组织切片的细胞中会释放出mRNA，迁移到每个spot的mRNA会被标记上相应的barcode序列，然后进行文库构建并进行测序。根据数据的条形码信息对数据进行分析，以确定哪些数据来自哪个位置，从而实现空间基因表达的可视化。欧易生物具有上百例空间转录组项目执行经验，致力通过高效的服务，助力各位科研工作者取得新的突破。
空间转录组（Spatial Transcriptomics）就是将基因的表达情况与关注的组织切片的免疫化学染色图像进行整合，从而将组织内不同细胞的基因表达信息定位到组织的原始空间位置上去，进而直接观测组织中不同部位功能区基因表达的差异。空间转录组技术利用了常规的原位技术和组学技术两方面的优势。目前已发表的关于空间转录组技术有主要有 Spatial Transcriptomics, Slide-seq, LCM-seq, seqFISH, MERFISH, Liver single cell zonation, Geo-seq 和 Tomo-seq, 涉及物种有人、小鼠、果蝇、秀丽隐杆线虫、斑马鱼、拟南芥、杨树和云杉等。空间转录组这对于发育生物学等众多领域的研究都具有重要的意义。
1. 10x Genomics空间转录组用于文库构建的每张载玻片上有四个捕获区域，每个捕获区域的大小为6.5x6.5mm，包含5000个被条形码标记的点（barcoded spots），每个点的直径为55 μm，点和点之间中心的距离为100 μm，并且每个点都有一个barcode序列。10X Visium空间转录组的实验主要分为两部分：组织学板块和组学板块。组织学板块包括样品的包埋、切片、固定、染色及成像，记录切片的形态学信息；组学板块包括cDNA的合成、扩增、接头连接和测序，记录切片的转录本信息和空间位置信息 。空间转录组技术重点为特殊的载玻片。云南欧易生物空间转录组有什么用
空间转录组可以进行细胞间通讯分析，区别在于空间位置信息可以同时用于识别潜在的细胞间相互作用。上海欧易生物空间转录组应用
空间基因表达技术能够在保留空间背景信息的同时，多方位测量转录组谱。然而，现有的分析方法并没有解决技术分辨率有限或有效利用空间信息的问题。来自美国的科研团队开发了BayesSpace，这是一种完全贝叶斯统计方法，它使用来自空间邻域的信息来增强空间转录组数据的分辨率并进行聚类分析。BayeSpace通过使用的Bioconductor SingleCellExperiment数据结构将预处理数据作为输入，无缝集成到空间转录组分析工作流中，输出同样存储在SingleCellExperiment对象中，该对象可用于下游分析。欧易生物具有上百例空间转录组项目执行经验，致力通过质量的服务，助力各位科研工作者取得新的突破。上海欧易生物空间转录组应用
上海欧易生物医学科技有限公司位于联航路1188号25幢，是一家专业的检验检测服务。（依法须经批准的项目，经相关部门批准后方可开展经营活动，具体经营项目以相关部门批准文件或许可证件为准）一般项目：生物医药产品、生化产品的研发，医药中间体、化工原料及产品（除危险品化学品、监控化学品、易制毒化学品）的研发、销售，仪器仪表的销售，并提供相关技术咨询、技术服务，会务服务，企业管理咨询。公司。在欧易生物近多年发展历史，公司旗下现有品牌欧易生物等。公司不仅*提供专业的检验检测服务。（依法须经批准的项目，经相关部门批准后方可开展经营活动，具体经营项目以相关部门批准文件或许可证件为准）一般项目：生物医药产品、生化产品的研发，医药中间体、化工原料及产品（除危险品化学品、监控化学品、易制毒化学品）的研发、销售，仪器仪表的销售，并提供相关技术咨询、技术服务，会务服务，企业管理咨询。，同时还建立了完善的售后服务体系，为客户提供良好的产品和服务。诚实、守信是对企业的经营要求，也是我们做人的基本准则。公司致力于打造***的科研服务，科研检测，学术研究，技术咨询。