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湖北实力空间转录组

来源: 发布时间:2021年11月30日

本文利用空间转录组学研究了在AD小鼠模型中,淀粉样斑块周围直径为100mm的组织域中发生的转录变化。发现了富含髓鞘和少突胶质细胞基因(OLIGs)的基因共表达网络的早期改变,而斑块诱导的基因(PIGs)的多细胞基因共表达网络涉及补体系统、氧化应激、溶酶体和炎症,在疾病的后期非常突出。此外作者通过对小鼠和人脑切片进行原位测序(ISS),证实了大多数观察到的细胞水平的变化。空间转录组学分析为探究AD和其他脑部疾病致病特征附近失调的细胞网络提供了可能。空间转录组是一项前沿技术,涉及到很多细节方面的准备工作。湖北实力空间转录组

1. 空间转录组是一种用于从空间层面上解析RNA-seq数据的技术,从而解析单个组织切片中的所有mRNA。空间转录组的条形码逆转录oligo(dT)引物在显微镜载玻片表面的有序附着,空间转录组使得在mRNA样品处理和后续测序过程中位置信息的编码和获取成为可能。单细胞RNA测序或组织样本RNA测序,均无法为研究人员提供精确的空间信息。通过空间转录组技术可获取组织中具体的位置的转录信息,为研究和诊断提供有效数据支撑。10x Genomics空间转录组技术可以应用于免疫、发育、神经和病理等研究方向。品质空间转录组空间转录组使得我们在检测基因表达的同时获得基因在组织内部的空间位置信息。

空间转录组研究的的必要性。研究单细胞我们想要探究细胞间的异质性,但是常规的单细胞是将细胞解离成单细胞悬液,然后利用单细胞分离技术(微孔,微板,液滴)等方法实现单细胞建库,这里比较大的问题是是细胞失去了原本在组织的空间信息。然而这个空间信息在实际研究中有很重要。特别是在研究细胞命运机制及细胞谱系发生空间位置的信息显得尤为重要,因此发展空间转录组技术实现细胞的位置信息的保留,对研究此类细胞状态尤为必要。

和单细胞转录组一样,空间转录组也可以进行细胞间通讯分析,区别在于空间位置信息可以同时用于识别潜在的细胞间相互作用。通常通过了解配体受体(LR)对并测试 LR 对是否更有可能在邻近细胞或 spot 中表达来完成。还有很多其他类型的分析可用于空间转录组学数据,包括基因模式的识别,空间区域的转录组定义, 基因间的相互作用推断,转录本的亚细胞定位以及基于H&E图像的基因表达估算等。1. 欧易生物具有上百例空间转录组项目执行经验,致力通过质量的服务,助力各位科研工作者取得新的突破。通过培训系统掌握空间转录组测序原理和方案设计思路,助力科学研究。

 **近,空间转录组学研究炙手可热。细胞及其在组织样本中的相对位置之间的关系对于理解疾病病理可能至关重要。空间转录组学是一项开创性的技术,它使科学家能够测量组织样本中的所有基因活性,并绘制出发生该活性的位置的图。该技术已经导致了新发现,这些新发现将有助于帮助科学家更好地了解生物过程和疾病。10x Genomics空间转录组技术可以应用于**、免疫、发育、神经和病理等研究方向。欧易生物具有上百例空间转录组项目执行经验,致力通过质量的服务,助力各位科研工作者取得新的突破。许多当前时代空间转录组技术的基础都是在自七十年代以来的几十年间建立的。运用空间转录组报价

空间转录组测序结果为未来人类心脏发育的研究提供重要的借鉴意义。湖北实力空间转录组

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