您好,欢迎访问

商机详情 -

四川欧易生物空间转录组使用

来源: 发布时间:2021年11月27日

空间转录组(Spatial Transcriptomics)就是将基因的表达情况与关注的组织切片的免疫化学染色图像进行整合,从而将组织内不同细胞的基因表达信息定位到组织的原始空间位置上去,进而直接观测组织中不同部位功能区基因表达的差异。空间转录组技术利用了常规的原位技术和组学技术两方面的优势。目前已发表的关于空间转录组技术有主要有 Spatial Transcriptomics, Slide-seq, LCM-seq, seqFISH, MERFISH, Liver single cell zonation, Geo-seq 和 Tomo-seq, 涉及物种有人、小鼠、果蝇、秀丽隐杆线虫、斑马鱼、拟南芥、杨树和云杉等。获取空间转录组中各个spot的细胞类型注释信息。四川欧易生物空间转录组使用

10x  Genomics空间转录组用于文库构建的每张载玻片上有四个捕获区域,每个捕获区域的大小为6.5x6.5mm,包含5000个被条形码标记的点(barcoded spots),每个点的直径为55 μm,点和点之间中心的距离为100 μm,并且每个点都有一个barcode序列。组织切片的细胞中会释放出mRNA,迁移到每个spot的mRNA会被标记上相应的barcode序列,然后进行文库构建并进行测序。根据数据的条形码信息对数据进行分析,以确定哪些数据来自哪个位置,从而实现空间基因表达的可视化。欧易生物具有上百例空间转录组项目执行经验,致力通过高效的服务,助力各位科研工作者取得新的突破。山东空间转录组质量空间转录组学和 10X Visium 依靠这种微阵列技术,区别在于微阵列载玻片上的组织上的转录本信息。

欧易生物高级技术支持陈老师首先给大家介绍了空间转录组学的发展历程、测序流程及原理。紧接着,欧易生物技术支持姚老师针对目前空间转录组学发表的一系列高分文章进行了方案设计的解析。姜老师给大家详细介绍了空间转录组项目样本准备、切片、贴片等实验过程及注意事项,并带领大家到实验室实地观摩了整个实验过程,并就其中细节进行了讲解。董老师针对空间转录组10x Space Ranger的分析原理及结果进行了详细解析,并介绍了使用Seurat包进行数据挖掘的标准分析流程。

和单细胞转录组一样,空间转录组也可以进行细胞间通讯分析,区别在于空间位置信息可以同时用于识别潜在的细胞间相互作用。通常通过了解配体受体(LR)对并测试 LR 对是否更有可能在邻近细胞或 spot 中表达来完成。还有很多其他类型的分析可用于空间转录组学数据,包括基因模式的识别,空间区域的转录组定义, 基因间的相互作用推断,转录本的亚细胞定位以及基于H&E图像的基因表达估算等。1. 欧易生物具有上百例空间转录组项目执行经验,致力通过质量的服务,助力各位科研工作者取得新的突破。空间转录组可以进行细胞间通讯分析,区别在于空间位置信息可以同时用于识别潜在的细胞间相互作用。

空间转录组技术作为当今前沿的科研技术,相信很多老师都希望将其运用于自己的课题中,快速发表高分文章。欧易生物具有上百例空间转录组项目执行经验,致力通过质量的服务,助力各位科研工作者取得新的突破。由上海欧易生物医学科技有限公司(以下简称“欧易生物”)主办的“空间转录组学培训班”落下帷幕。培训中,欧易讲师团队以其丰富的项目经验及专业的生信能力,从空间转录组学的发展历程、测序原理、实验实操及数据挖掘等多维度,向远道而来的学员们展开了系统性的培训。


细胞通讯是单细胞研究中一个模拟与理解复杂组织生态系统动力学的适用方法。浙江欧易生物空间转录组是什么

除了皮肤、胰腺和骨头组织外,其余样本类型均可开展10x Genomics空间转录组研究。四川欧易生物空间转录组使用

空间转录组技术原理是什么?当组织冷冻切片附在空间转录组载片上时,条形码引物结合并从组织中捕获邻近的mRNA。被捕获的mRNA开始逆转录,得到的cDNA中包含了空间条形码。分析Illumina测序结果中空间条形码的序列,可以将每个mRNA转录的序列映射回组织切片中的起始位置。空间转录组的条形码逆转录oligo(dT)引物在显微镜载玻片表面的有序附着,空间转录组使得在mRNA样品处理和后续测序过程中位置信息的编码和获取成为可能。欧易生物具有上百例空间转录组项目执行经验,致力通过质量的服务,助力各位科研工作者取得新的突破。四川欧易生物空间转录组使用

上海欧易生物医学科技有限公司位于联航路1188号25幢,是一家专业的检验检测服务。(依法须经批准的项目,经相关部门批准后方可开展经营活动,具体经营项目以相关部门批准文件或许可证件为准)一般项目:生物医药产品、生化产品的研发,医药中间体、化工原料及产品(除危险品化学品、监控化学品、易制毒化学品)的研发、销售,仪器仪表的销售,并提供相关技术咨询、技术服务,会务服务,企业管理咨询。公司。在欧易生物近多年发展历史,公司旗下现有品牌欧易生物等。公司不仅*提供专业的检验检测服务。(依法须经批准的项目,经相关部门批准后方可开展经营活动,具体经营项目以相关部门批准文件或许可证件为准)一般项目:生物医药产品、生化产品的研发,医药中间体、化工原料及产品(除危险品化学品、监控化学品、易制毒化学品)的研发、销售,仪器仪表的销售,并提供相关技术咨询、技术服务,会务服务,企业管理咨询。,同时还建立了完善的售后服务体系,为客户提供良好的产品和服务。上海欧易生物医学科技有限公司主营业务涵盖科研服务,科研检测,学术研究,技术咨询,坚持“质量保证、良好服务、顾客满意”的质量方针,赢得广大客户的支持和信赖。