人类细胞图谱项目的主要目标之一是描述所有细胞类型的空间关系。同时基于表达特征对多种细胞类型进行空间映射，有助于研究不同细胞类型之间的相互作用。已经发展了一些策略来检测单细胞分辨率的空间基因表达谱，如Slide-seq、seqFISH或MERFISH。为了更有效地为研究群体探索空间基因表达数据，我们构建了SpatialDB数据库用于空间解析的转录组。
人类细胞图谱项目极大地推动了单细胞水平的生命科学研究。空间转录组学技术的发展和空间基因表达数据的快速积累是未来的发展趋势。我们将继续收集新的技术和数据集来更新SpatialDB。此外，我们将整合更多的工具和数据源来分析数据. 空间转录组使得我们在检测基因表达的同时获得基因在组织内部的空间位置信息。什么是空间转录组
空间转录组的一般流程2。这使得在后续步骤中覆盖细胞组织图像和基因表达数据成为可能。用我们的渗透试剂对组织进行渗透，这意味着在细胞膜上形成小孔。RNA分子可以通过这些通道离开细胞，并与芯片上相邻的捕获探针结合。因此，基因表达信息被捕获在芯片上。需要通过以下步骤将捕获的RNA分子中存储的信息转换为数据。cDNA合成是为了创造稳定的双链DNA分子。这是必要的，因为cdna - rna -杂交体的降解速度很快。此外，这是构建可测序文库之前的必要步骤。所有之前收集的信息都被汇集起来，可以在线访问。这意味着在实践中，您可以查看组织切片的图像并选择组织中的不同区域。然后你可以确定哪些基因在这些区域中以什么数量表达。因此，你可以在一个单一的实验中进行新分析。海南实力空间转录组空间转录组细胞通讯分析方法简介及实操。
空间转录组的应用有哪些？一、构建空间转录组图谱：借助于空间分辨的单细胞转录组学，建立图谱可能是在分子水平上研究生物体结构的重要步骤。目前的多项研究通过单细胞转录组技术结合空间转录技术，得到多个***的时空转录组图谱（相关研究后续会在如下专辑更新）。二、描绘胚胎发育和空间蓝图：胚胎发育是一个复杂的过程，其中动态变化在生物分子水平上迅速发生。对这种微观变化的时间和空间方面的分析都具有挑战性。预期使用空间转录组学技术可以表征胚胎发育的空间表达蓝图。
空间转录组数据分析的是根据每个芯片上每个 spot 的基因表达信息进行聚类，然后将 spot 根据坐标位置序列放回到组织的图像上，同时可以对每个 gene 在组织上表达的空间位置进行定位。获得测序数据后，首先利用 Space Ranger 软件可以自动化的对图像进行处理、数据比对和 Barcode 处理。另外一个软件 Loupe Cell Browser 是一个适用于 Windows 和 MacOS 的桌面应用程序，它可以快速、轻松地可视化和分析10X Visium 数据。欧易生物具有上百例空间转录组项目执行经验，致力通过质量的服务，助力各位科研工作者取得新的突破。空间转录组测序结果为未来人类心脏发育的研究提供重要的借鉴意义。
第二，数据库的建立。尽管当前空间转录组的数据在快速地增长，但尚未有对应的数据库来对这些数据进行汇总集成。第三，研究物种及组织的多样化。在当前时代，除 LCM 之外，研究的***主要集中于人类和小鼠的大脑，而其他***（例如肝脏）的空间转录组学研究相对滞后。对除人类和小鼠以外的其他生物以及除大脑以外的其他***的技术现代化，将为开发有用的空间转录组学地图集提供广阔的前景。第四，集成度高、交互性强、易扩展、文档信息完善的开源工作流程的开发。该类工具的开发将简化不同类型空间转录组学数据的整合和分析。从实验到分析一站式掌握空间转录组流程及原理。湖南欧易生物空间转录组有什么用
尽管前传时代的空间技术被迅速弃用，但其思想和方法是当今时代空间转录组学发展的基础。什么是空间转录组
空间转录组学(ST)是一种方法，允许在组织样本中可视化和定量分析转录组与空间分辨率。通过在载玻片上排列含有位置条形码的寡核苷酸的组织切片，该方法声称可以生成具有精确位置信息的高质量的RNA-seq cDNA文库。条形码芯片有1007个带有独特条形码序列的引物位点。每个位置都有一个直径100µm(对应于一个组织域)中心到中心的距离是200µm。欧易生物具有上百例空间转录组项目执行经验，在空间转录组样本处理、实验和数据挖掘上的成功经验，致力通过质量的服务，助力各位科研工作者取得新的突破。什么是空间转录组
上海欧易生物医学科技有限公司是一家检验检测服务。（依法须经批准的项目，经相关部门批准后方可开展经营活动，具体经营项目以相关部门批准文件或许可证件为准）一般项目：生物医药产品、生化产品的研发，医药中间体、化工原料及产品（除危险品化学品、监控化学品、易制毒化学品）的研发、销售，仪器仪表的销售，并提供相关技术咨询、技术服务，会务服务，企业管理咨询。的公司，致力于发展为创新务实、诚实可信的企业。欧易生物拥有一支经验丰富、技术创新的专业研发团队，以高度的专注和执着为客户提供科研服务，科研检测，学术研究，技术咨询。欧易生物致力于把技术上的创新展现成对用户产品上的贴心，为用户带来良好体验。欧易生物始终关注自身，在风云变化的时代，对自身的建设毫不懈怠，高度的专注与执着使欧易生物在行业的从容而自信。